1.進入phred官網，給作者寫信，獲得所需的軟件，大約需要兩三天的時間即可收到回信。

2.根據作者的指示下載，解壓相應軟件。

3.以筆者本人的安裝為例unbuntu系統（phred自帶的installtion太麻煩了）

4.新建文件夾：

mkdir phred

5:將下載的壓縮文件移到新建的文件夾中：

mv phred-dist-071222.c-acd.tar.gz

6.解壓文件

tar -zxvf phred-dist-071220.c-acd.tar.gz

7.編譯一下：

make

8：添加環境變量：

在home目錄下：vi .bashrc添加一下三行內容：

export PATH=/home/lmt/desktop/phred:$PATH
PHRED_PARAMETER_FILE=/home/lmt/desktop/phred/phredpar.dat
export PHRED_PARAMETER_FILE

9：激活剛添加的環境變量：

source .bashrc

10：檢驗一下我們安裝的Phred是否安裝好了及環境變量添加好了

在任何路徑下（非phred所在路徑）輸入一下命令：

phred -help

如果安裝正確，路徑添加正確，就會出現phred的用法提示。

11：安裝完成。

測序分析軟件-phred的安裝