生物科研軟件（從科研到發文章）(轉自小木蟲）
阿新 • • 發佈：2017-08-13
path bat photos ora pro 統計 line 特色 數據
EndNote X1，文獻管理軟件，平時方便論文管理，寫文章的時候插入文獻也是相當的方便；
RefViz 2.1，文獻分析軟件，與EndNote結合使用，分析文獻，可以省掉大把自己看自己歸納的時間；
ReferenceManager似乎很久沒有更新了，Thomoson看來以後可能只管EndNote了。
2.分子生物學綜合軟件：
Vector NTI 10.3，分子生物學的綜合軟件，什麽功能幾乎都全了；
BioEdit 7，雜七雜八的功能湊在一起的一個分子生物學軟件，有些罕見的Vector NTI所沒有的功能；
DNAMAN 6，與Vector NTI類似的一個軟件，但是圖型化上做的很差，集成度和序列的管理功能比Vector NTI差的不是一點點，罕用，但有時候有些序列的格式非得要用它的樣子排，沒有辦法；
3. 大分子二維/三維結構繪圖軟件：
PyMol 0.99，有1.0，可惜要錢了，也沒有P-J。蛋白質三維結構查看軟件，神奇的就在於它可以編輯小範圍內的結構；
DeepViewer 3.7，PDB Viewer的換湯不換藥升級版，在預測功能上有所突破，期待新版本的出現令其可與PyMol有的一拼，誰叫PyMol在Windows下開始收錢呢？為了一個PyMol裝個Linux似乎還沒有這樣大的動力；
RNADraw 1.1，RNA和DNA二級結構的分析軟件，可以分析做PCR的時候的引物的二聚體，更直觀一些；
Accelery Insight II，Linux下的大型三維結構模擬軟件，2.1 G！據稱是非常強大。為了這個裝個Linux似乎還說的過去。
4. 質粒繪圖軟件：
Vector NTI和DNAMAN其實也可以畫，但是不如下面這幾個來的專業或方便：
SimVector 4，與Primer Premier同一家公司的軟件，畫質粒的一個軟件，效果還行，與VectorNTI畫出來的風格不一樣，有的雜誌喜歡；
WinPlas 2.7，很老的質粒繪圖軟件，很久沒有升級了，畫出來的質量非常差，可是小，比較快；
Visual Cloning 3.2.4，一個界面豪華的質粒及克隆整個過程的畫圖軟件，大而慢，選用。
5. 引物設計軟件：
Primer premier 5，引物設計軟件，大家都用，我也用；
Oligo 6.7包1，引物設計軟件，大家都用，我還用，設計Fusion PCR和In-Fusion連接的引物的時候，比Primer premier直觀一些；
Allele ID 6.0/Beacon Designer 7.0，RT-PCR設計軟件，與Primer Premier同一家公司的軟件，軟件界面非常相似，到現在也沒有搞清楚兩個有什麽區別，不知道有什麽意思，具體還需要試一下；
6. 辦公軟件：
Microsoft WORD 2003，不說了；
Microsoft Excel 2003，不說了；
Microsoft PowerPoint 2003，不說了；
Adobe Acrobat Professional 8.1，不說了；
PDF2Office 2.0，把PDF轉成WORD，中文支持大大的好，但頁面格局往往破壞的一塌糊塗；
Adult PDF Password Recovery 2.3，看名字就知道幹什麽的了，相當強大，加密的PDF往往不能取詞不能打印；
SolidPDFConverter 3.0，把PDF轉成WORD，中文支持大大的不好；
7. 凝膠分析軟件：
QuantityOne 4.6.2，BioRad的凝膠成像儀自帶的電泳圖像軟件，算很好上手的了；
GelPro Analyzer 4.5，跑膠和雜交以及菌落的分析軟件，已有6.0版，可惜我這裏沒有破解版；
PDQuest 8.0.1 Advance，BioRad的二維電泳分析軟件，算好用的，功能上沒用過其它的，真的不好說；
代謝網絡和信號傳導分析軟件：
CellNetAnalyzer 6.0，以前叫FluxAnalyzer，基於MatLab的代謝網絡和信號傳導網絡分析模塊，大部分論文中的代謝網絡分析都是或明或暗的用這個分析的；
PathwayStudio 5.0，蛋白質相互作用、細胞信號轉導和代謝分析的軟件；
8. 圖片處理：
圖片是用來表達思想最有力的工具了，所以在這裏就多了一些。
Adobe Photoshop CS3 Extended，修改圖片，可以做出以假亂真的效果，功能非常強大，但在畫示意圖上不是很方便，對線條和幾何圖形的支持尤為不便；
Adobe Streamline 4，好久沒有升級的一個軟件，把位圖轉成矢量圖的一個軟件，很好用；
Image-Pro Plus 6.0，對圖象進行加工處理並得到數據的軟件，專業，相當的專業，已有6.2版，可惜我這裏沒有破解版；
Adobe Fireworks CS3/Illustrator CS3，矢量圖和位圖工具二合一，可以畫一些復雜的圖，像GENE，MCB上面的很多圖都可以很輕松的用Fireworks/Illustrator畫出來，流程圖，細胞結構，各種復雜的示意圖等等都沒有問題，矢量工具非常好用。Fireworks更適合入門。Illustrator是純粹的矢量軟件，新手用起來可能會有點不適應，特別是從Photoshop轉過來的新手；
ChemSketch 10，畫分子結構式的，幾乎可以勝任所有的化學結構式的任務了；
SnagIt 8.5，抓圖軟件，同類軟件裏面最好用的一個了，連續截屏和延遲截屏是最大特色；
9. 流程圖軟件：
Microsoft Visio 2003，畫流程圖和一些復雜的示意圖，與SmartDraw類似，但是在PPT裏面的顯示效果遠勝SmartDraw，因為與PPT是一家的，兼容性更好，更方便；
SmartDraw 7.7，畫流程圖和一些復雜的示意圖；
ConceptDraw 7.5 Professional，SmartDraw在接下來一段時間內的強有力的競爭對手，雖然SmartDraw 8 Professional進行了升級，但是卻不再支持中文，相當讓人失望，ConceptDraw這時候具有了天然的競爭優勢了；
10. 數學統計軟件：
OriginPro 8.0 SP1，畫各種各樣的曲線圖，兼做簡單的數據處理；
SigmaPlot 10.0，與Origin類似，畫出來的圖風格不大一樣，OriginPro 8.0推出之後，SigmaPlot已經漸顯頹勢，期待新版本了；
SigmaStat 3.5，分析為主的一個小統計軟件，在SigmaPlot中可以調用它，如果不用SigmaPlot，個人感覺其沒有任何意義；
SPSS 16，大型的分析軟件，幾乎擁有所有的統計分析功能；
MatLab 7.1，呵呵，這樣說吧，數學裏面的，幾乎什麽都可以；
SAS JMP 7.0，SAS公司為了解決SAS難用而開發的一個軟件，據一位專業級的統計分析人物推薦，覺得SPSS太不中用，還是SAS家的東西可靠些。
另外還有很多常見的分析軟件如SAS 9.1，Statistica 7.0， SysStat 12.0等等，功能上都差不多，都很強大，但我們還是實驗為主，能完成任務即可，實際上學精任何一個都足夠用了。
其它：
UltraEdit 13.10a，取代記事本的一個強大軟件，很多時候會用到，比如把CNKI的數據導到EndNote，有些軟件的16進制下的P-J；
這些軟件目前而言，應該可以對付從科研到發文章的所有的事情了
生物科研軟件（從科研到發文章）(轉自小木蟲）
1.文獻管理與分析：EndNote X1，文獻管理軟件，平時方便論文管理，寫文章的時候插入文獻也是相當的方便；
RefViz 2.1，文獻分析軟件，與EndNote結合使用，分析文獻，可以省掉大把自己看自己歸納的時間；
ReferenceManager似乎很久沒有更新了，Thomoson看來以後可能只管EndNote了。
2.分子生物學綜合軟件：
Vector NTI 10.3，分子生物學的綜合軟件，什麽功能幾乎都全了；
BioEdit 7，雜七雜八的功能湊在一起的一個分子生物學軟件，有些罕見的Vector NTI所沒有的功能；
DNAMAN 6，與Vector NTI類似的一個軟件，但是圖型化上做的很差，集成度和序列的管理功能比Vector NTI差的不是一點點，罕用，但有時候有些序列的格式非得要用它的樣子排，沒有辦法；
3. 大分子二維/三維結構繪圖軟件：
PyMol 0.99，有1.0，可惜要錢了，也沒有P-J。蛋白質三維結構查看軟件，神奇的就在於它可以編輯小範圍內的結構；
DeepViewer 3.7，PDB Viewer的換湯不換藥升級版，在預測功能上有所突破，期待新版本的出現令其可與PyMol有的一拼，誰叫PyMol在Windows下開始收錢呢？為了一個PyMol裝個Linux似乎還沒有這樣大的動力；
RNADraw 1.1，RNA和DNA二級結構的分析軟件，可以分析做PCR的時候的引物的二聚體，更直觀一些；
Accelery Insight II，Linux下的大型三維結構模擬軟件，2.1 G！據稱是非常強大。為了這個裝個Linux似乎還說的過去。
4. 質粒繪圖軟件：
Vector NTI和DNAMAN其實也可以畫，但是不如下面這幾個來的專業或方便：
SimVector 4，與Primer Premier同一家公司的軟件，畫質粒的一個軟件，效果還行，與VectorNTI畫出來的風格不一樣，有的雜誌喜歡；
WinPlas 2.7，很老的質粒繪圖軟件，很久沒有升級了，畫出來的質量非常差，可是小，比較快；
Visual Cloning 3.2.4，一個界面豪華的質粒及克隆整個過程的畫圖軟件，大而慢，選用。
5. 引物設計軟件：
Primer premier 5，引物設計軟件，大家都用，我也用；
Oligo 6.7包1，引物設計軟件，大家都用，我還用，設計Fusion PCR和In-Fusion連接的引物的時候，比Primer premier直觀一些；
Allele ID 6.0/Beacon Designer 7.0，RT-PCR設計軟件，與Primer Premier同一家公司的軟件，軟件界面非常相似，到現在也沒有搞清楚兩個有什麽區別，不知道有什麽意思，具體還需要試一下；
6. 辦公軟件：
Microsoft WORD 2003，不說了；
Microsoft Excel 2003，不說了；
Microsoft PowerPoint 2003，不說了；
Adobe Acrobat Professional 8.1，不說了；
PDF2Office 2.0，把PDF轉成WORD，中文支持大大的好，但頁面格局往往破壞的一塌糊塗；
Adult PDF Password Recovery 2.3，看名字就知道幹什麽的了，相當強大，加密的PDF往往不能取詞不能打印；
SolidPDFConverter 3.0，把PDF轉成WORD，中文支持大大的不好；
7. 凝膠分析軟件：
QuantityOne 4.6.2，BioRad的凝膠成像儀自帶的電泳圖像軟件，算很好上手的了；
GelPro Analyzer 4.5，跑膠和雜交以及菌落的分析軟件，已有6.0版，可惜我這裏沒有破解版；
PDQuest 8.0.1 Advance，BioRad的二維電泳分析軟件，算好用的，功能上沒用過其它的，真的不好說；
代謝網絡和信號傳導分析軟件：
CellNetAnalyzer 6.0，以前叫FluxAnalyzer，基於MatLab的代謝網絡和信號傳導網絡分析模塊，大部分論文中的代謝網絡分析都是或明或暗的用這個分析的；
PathwayStudio 5.0，蛋白質相互作用、細胞信號轉導和代謝分析的軟件；
8. 圖片處理：
圖片是用來表達思想最有力的工具了，所以在這裏就多了一些。
Adobe Photoshop CS3 Extended，修改圖片，可以做出以假亂真的效果，功能非常強大，但在畫示意圖上不是很方便，對線條和幾何圖形的支持尤為不便；
Adobe Streamline 4，好久沒有升級的一個軟件，把位圖轉成矢量圖的一個軟件，很好用；
Image-Pro Plus 6.0，對圖象進行加工處理並得到數據的軟件，專業，相當的專業，已有6.2版，可惜我這裏沒有破解版；
Adobe Fireworks CS3/Illustrator CS3，矢量圖和位圖工具二合一，可以畫一些復雜的圖，像GENE，MCB上面的很多圖都可以很輕松的用Fireworks/Illustrator畫出來，流程圖，細胞結構，各種復雜的示意圖等等都沒有問題，矢量工具非常好用。Fireworks更適合入門。Illustrator是純粹的矢量軟件，新手用起來可能會有點不適應，特別是從Photoshop轉過來的新手；
ChemSketch 10，畫分子結構式的，幾乎可以勝任所有的化學結構式的任務了；
SnagIt 8.5，抓圖軟件，同類軟件裏面最好用的一個了，連續截屏和延遲截屏是最大特色；
9. 流程圖軟件：
Microsoft Visio 2003，畫流程圖和一些復雜的示意圖，與SmartDraw類似，但是在PPT裏面的顯示效果遠勝SmartDraw，因為與PPT是一家的，兼容性更好，更方便；
SmartDraw 7.7，畫流程圖和一些復雜的示意圖；
ConceptDraw 7.5 Professional，SmartDraw在接下來一段時間內的強有力的競爭對手，雖然SmartDraw 8 Professional進行了升級，但是卻不再支持中文，相當讓人失望，ConceptDraw這時候具有了天然的競爭優勢了；
10. 數學統計軟件：
OriginPro 8.0 SP1，畫各種各樣的曲線圖，兼做簡單的數據處理；
SigmaPlot 10.0，與Origin類似，畫出來的圖風格不大一樣，OriginPro 8.0推出之後，SigmaPlot已經漸顯頹勢，期待新版本了；
SigmaStat 3.5，分析為主的一個小統計軟件，在SigmaPlot中可以調用它，如果不用SigmaPlot，個人感覺其沒有任何意義；
SPSS 16，大型的分析軟件，幾乎擁有所有的統計分析功能；
MatLab 7.1，呵呵，這樣說吧，數學裏面的，幾乎什麽都可以；
SAS JMP 7.0，SAS公司為了解決SAS難用而開發的一個軟件，據一位專業級的統計分析人物推薦，覺得SPSS太不中用，還是SAS家的東西可靠些。
另外還有很多常見的分析軟件如SAS 9.1，Statistica 7.0， SysStat 12.0等等，功能上都差不多，都很強大，但我們還是實驗為主，能完成任務即可，實際上學精任何一個都足夠用了。
其它：
UltraEdit 13.10a，取代記事本的一個強大軟件，很多時候會用到，比如把CNKI的數據導到EndNote，有些軟件的16進制下的P-J；
這些軟件目前而言，應該可以對付從科研到發文章的所有的事情了
生物科研軟件（從科研到發文章）(轉自小木蟲）