25、轉錄本(transcript)組成(gtf文件的第三列)

阿新 • • 發佈：2017-08-20

技術 top 不一定 idt 分享 orf 一個 2.3 ear

轉錄本(transcript)長度範圍 3214482 到3671498

3214482--3216021----3216022--3216024----3216025--3216968----3421702--3421901----3670552--3671348----3671346--3671348----3671349--3671498

3UTR stop_codon CDS3 | | CDS2 | | CDS1 start_codon 5UTR

| | | |

3214482------------------------------------------------------------3216968----3421702--3421901----3670552-----------------------------------------------------------3671498

exon3(3UTR,stop_codon, CDS3) exon3(CDS2) exon1(5UTR,stop_codon, CDS1)

解釋　transcript、UTR、stop_codon、exon、CDS、start_codon關系

CDS，是編碼一段蛋白產物的序列。cds必定是一個orf。但也可能包括很多orf。反之，每個orf不一定都是cds。開放閱讀框（ORF）是基因序列的一部分,有內含子的

，且包含一段可以編碼蛋白的堿基序列。由於擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段堿基序列產生合適大小蛋白才出現的終止密碼子,該段堿基序列編碼一個蛋白。OEF排除內含子就是CDS

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25、轉錄本(transcript)組成(gtf文件的第三列)

技術 top 不一定 idt 分享 orf 一個 2.3 ear 轉錄本(transcript)長度範圍 3214482 到3671498 3214482--3216021----3216022--3216024----3216025--3216968----3421702

ORMLite完全解析（三）官方文件第三章、自定義查詢構造器 Custom Query Builder

接著上一篇，下面是第三章的翻譯整理，理解錯誤的地方還請批評指正。第三章、自定義查詢構造器 3.1 查詢構造器基礎下面是使用查詢構造器建立自定義查詢語句的基本步驟。首先，以java常量的形式為屬性設定列名，便於使用它們進行

轉錄本組裝軟體StringTie的使用說明

轉錄本組裝軟體StringTie的使用說明 StringTie 轉錄本組裝軟體StringTie的使用說明轉錄組分析流程 HISTA + StringTie 組合。其Protocol 發表在Nature Protocol 上“Transcript-level exp

如何通過RNA-Seq瞭解轉錄本的結構

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提取最長轉錄本的程式碼

1.最長轉錄本：就是gene的id相同，但是序列的長度不一樣，應該挑選出序列最長作為後面的分析下面就是一個轉錄本的id檔案，都是來自同一個gene,但是轉錄本的id和長度均不相同分析：發現除了第4列表示的基因id相同以外，其他的列均不相同。 2.過濾最長轉錄本的程式

取轉錄本fasta最長的當作基因fasta

#!/usr/bin/env perl use warnings; use strict; use Bio::SeqIO; die "perl $0 <fasta> > <outfile>\n" if(@ARGV != 1); my @le

25、Java並發性和多線程-阻塞隊列

多線程 throws clas cep ted this return exception exceptio 以下內容轉自http://ifeve.com/blocking-queues/：阻塞隊列與普通隊列的區別在於，當隊列是空的時，從隊列中獲取元素的操作將會被阻塞，

【轉】python qt(pyqt)的文件打開、文件保存、文件夾選擇對話框

utf spl 文件對話框出現 tin ans none 轉換選擇文件夾 import PyQt4.QtCore,PyQt4.QtGui # 獲取文件路徑對話框 file_name = QFileDialog.getOpenFileName(self,"open

（轉）關於Tomcat的點點滴滴（體系架構、處理http請求的過程、安裝和配置、目錄結構、設置壓縮和對中文文件名的支持、以及Catalina這個名字的由來……等）

https 設置重啟 specific 調用持久化數據所在 original apps 轉自：http://itfish.net/article/41668.html 總結Tomcat的體系架構、處理http請求的過程、安裝和配置、目錄結構、設置壓縮和對中文文件名

expect腳本同步文件、指定host和要同步的文件、構建文件分發系統、批量遠程執行命令

expect腳本 expect遠程同步 expect腳本同步文件 1.自動同步文件 [root@garytao-01 shell]# vi 4.expect 增加如下腳本內容： #!/usr/bin/expect set passwd "123456" spawn rsync -av root@1

java--Fibonacc由數字1、1、2、3...組成的，從第三個數字起每一個數字為前兩個數字的和。建立一個方法，接受一個整數引數，顯示從第一個元素開始總共由該引數指定的個數所構成的所有斐波那契數

題目完整描述：一個斐波那契數列是由數字1、1、2、3、5、8、13、21、34等等組成的，其中每一個數字(從第三個數字起)都是前兩個數字的和。建立一個方法，接受一個整數引數，並顯示從第一個元素開始總共由該引數指定的個數所構成的所有斐波那契數字。例如，如果執行 java Fibonacci 5(Fib

用1、2、3、4四個數字組成不重複數字的三位數，能組成多少個？

public static void main(String[] args) { int sum=0; for (int i = 1; i < 5; i++) { for (int j = 1; j < 5; j++) { for (int

ASP.NET Core 2.1 : 十二.內置日誌、使用Nlog將日誌輸出到文件（轉）

layout short including 文件名 rdquo 1.0 復雜 net 當前應用離不開日誌，雖然現在使用VS有強大的調試功能，開發過程中不復雜的情況懶得輸出日誌了（想起print和echo的有木有），但在一些復雜的過程中以及應用日常運行中的日誌還是非常有用

win、mac 設置 php上傳文件大小限制

保存上傳根據 -- pla 功能 spa limit 最大的修改php.ini win平臺WAMP修改步驟左鍵點擊wamp 選擇php 在彈出的窗口中選擇php.ini 在打開的文件中進行修改(修改步驟如下) 修改完畢,保存並重啟wamp mac

【java】遞歸統計本地磁盤所有文件，提取重復文件，JDK8 map叠代

this ash down logs out 文件名 pub new 重復 package com.sxd.createDao; import java.io.File; import java.time.LocalDateTime; import java.util.

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訪問性定期找到應用程序生成新版本都是每次發生 IIS上部署的ASP.NET站點都會在一個.Net Framework的特定目錄下生成臨時編譯文件增加ASP.NET站點的訪問性能，有時候需要手動去刪除這些臨時編譯文件，特別是發布新版本代碼到IIS後，如果發現新

[轉]html頁面調用js文件裏的函數報錯onclick is not defined處理方法

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【轉】Java壓縮和解壓文件工具類ZipUtil

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shell腳本執行及配置文件

bashlinux之shell腳本執行及配置文件bash腳本執行方法: 1 解釋器直接運行 /usr/bin/bash bash FOO.sh 2 使用路徑運行腳本(需要有x權限) chmod +x FOO.sh /PATH/TO/FOO.sh

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