一） 安裝流程軟件

下載軟件，配置環境變量，這裏不做介紹

二)下載原始數據

2.1）建SRR_Acc_List.txt文件放置將要下載的SRR號(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra?term=SRP033351)

#查看step1腳本的內容:cat step1_download_rawdata.sh
echo start at time 
cat /home/jxdong/airway/doc/SRR_Acc_List.txt |while read id ;do (prefetch  ${id} &);done
echo finish at time 
##投遞腳本
nohup bash step1_download_rawdata.sh &
##如果下載速度很慢的話，用下面的命令殺掉：
#ps -ef |grep prefetch|awk ‘{print $2}‘|while read id ;do kill ${id};done
 

結果：該步驟會自動生成一個文件夾裏面放置的下載的數據：/home/jxdong/ncbi/public/sra

l -lh /home/jxdong/ncbi/public/sra

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