全基因組選擇中準確性的影響因素
文章目的: 比較全基因組選擇中準確性的影響因素
主要考慮的因素有:
- 比較不同方法: BLUP, GBLUP, SSBLUP
- 不同遺傳力: 0.1, 0.2, 0.5
- 不同標記數: 10k 和50k
- 不同訓練群體數(Training Set, TS): 1000, 2000, 3000, 4000, 5000
主要結論:
- 1, 準確性隨著標記密度增加, 隨著遺傳力的增高, 而增高
- 2, 在訓練群體為1000時, GBLUP和SSBLUP的準確性並不比傳統BLUP方法高
- 3, 對於遺傳力為0.5個性狀, 訓練群體的數目至少要達到300, GBLUP和SSBLUP才會比傳統BLUP準確性高
- 4, 對於低遺傳力(0.1)的性狀, SSBLUP比GBLUP的準確性要高,對於高遺傳力的性狀, SSBLUP優勢不明顯.
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