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差異表達基因分析[轉載]

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1.轉錄組

2.轉錄組研究重要性

3.轉錄組研究技術

3.1三種的比較

3.2技術比較

4.高通量測序技術的應用

5.轉錄組資料分析

6.差異表達基因分析

4.1FC法——差異表達倍數法

那麼也就是說A與B是2倍的關係。

4.2卡方檢驗

7.假設檢驗存在的問題

7.1 t檢驗差異基因

我終於知道是怎麼進行t檢驗找差異表達基因了,應該是聚類之後單細胞被確定為不同的細胞型別,那麼將這些細胞型別子集中的每一個基因表達抽取出來,對每一個基因來說

都能夠形成一個向量,都會做一次假設檢驗;那麼比如說有5種細胞型別,那麼就第一組作為x1,其他4種分別作為x2,這樣去做t檢驗,判斷是否是差異表達基因。

7.2方差分析

8.趨勢性上調或者下調

我的理解是,在判斷差異基因的時候,調整FC的閾值,胡總和是相關係數的閾值,這樣就會有得到更多或者更少的差異表達基因。

9.GO分析