科研日常中會在Linux系統下使用到很多shell 命令，有很多十分有用的命令。當要實現一個功能時，可能需要非常簡單的幾個單詞和字母即可，在此將自己常用的命令做一總結，方便查閱。

1. 選取命令cut

cut主要用來對同一行裡的資料進行分解，對字串切割。

cut -d '分割字元' -f fields   #用於分割字元；
cut -c 字元範圍                 #用於分割排列整齊的資訊；

舉例：

$ a=123:456:789
$ echo $a | cut -d ':' -f 2
456
$ b=`echo $a | cut -d ':' -f 2` ; echo $b
456
$ c=` echo $a  | cut -b 5-7` ; echo $c
456
$ echo $a | cut -c 5-7
456
 

2. 查詢命令grep

grep主要用來查詢，若有需要的資訊，則會查找出來；

grep [-acinv] [--color=auto] '查詢字串' filename
-a: 將binary檔案以text檔案的方式進行查詢資料；
-c: 計算找到‘查詢字串‘的次數；
-i: 忽略大小寫；
-n: 輸出行號；
-v: 反向選擇，即顯示出沒有查詢字串的行；
--color=auto: 將找到的關鍵字用顏色顯示；

舉例：
檔案data.txt內容如下：
001 liming 1995 aaa
002 lily 1988 aaa
003 danilise 1999 bbb
004 david 2003 bbb

$ grep 'aaa' data.txt #輸出查詢到的內容；
001 liming 1995 aaa
002 lily 1988 aaa
$ grep -c 'aaa' data.txt #輸出查詢到的個數；
2
$ grep -n 'aaa' data.txt #加上行號；
1:001 liming 1995 aaa
2:002 lily 1988 aaa
$ cat data.txt | grep 'bbb'
003 danilise 1999 bbb
004 david 2003 bbb

cut與grep聯合使用

舉例：

$ cat data.txt | grep 'bbb' | cut -d ' ' -f2
danilise
david