一般出現在從別處import的專案上，只有專案資料夾上有紅叉，其他地方都正常，現總結個人的幾個解決方案：

有幾種可能：
1，編碼設定是否一致，也即是你專案原來的編碼和現在eclipse用的預設編碼是否一致
2，匯入專案中jar路徑可能已經被改變，多數情況下都是這個原因造成，我也曾經遇見過，你要確保你的jar包路徑都沒問題。myeclipse有檢視jar路徑的檢視你可切換看看，報紅X的就都是路徑被改動過的，重新加進來就OK。
3，在problem控制檯裡有如下錯誤提示：Java compiler level does not match the version of the installed Java project facet。這種情況一般可以在專案上右鍵-->properties-->然後找到project facets和 Java Compiler兩個選項，修改其使用的jdk版本即可。如果沒有找到project facets選項，可以參考下面的方法：

當你安裝了兩個版本的JDK，用了兩個IDE開發工具，比如兩個myeclipse，Myeclipse8.5和Myeclipse9.0。
這時候涉及到了jdk版本的問題，而在Myeclipse中設定是比較隱藏的。
Eclipse下有個專案報如上錯誤，這個是因為Facted Project 中的Java 版本設定與專案的Java 版本設定不一致。而如果使用的是MyEclipse的話，這個配置修改起來就不是很方便，具體方法稍後再說。如果是eclipse jee版本，則使用javaee外掛是wtp，在wtp環境在，在當前專案上點右鍵，屬性--Project Facets中，配置編譯版本與java compiler的版本一致，問題即解決了。
MyEclipse中沒有Project Facets配置選項，則需要到當前專案的.settings資料夾下，找到org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml檔案，其內容如下：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<faceted-project>
<fixed facet="wst.jsdt.web"/>
<installed facet="java" version="1.6"/>
<installed facet="jst.web" version="2.5"/>
<installed facet="wst.jsdt.web" version="1.0"/>
</faceted-project>
其中<installed facet="java" version="1.6"/>這行就是faceted project的編譯級別配置。<installed facet="jst.web" version="2.5"/>這行配置在某些情況下也需要修改，比如在MyEclipse中建了個web專案，後來又匯入到eclipse jee，有時候就需要修改這個配置。
儲存配置後，重新整理並build專案後，問題解決。