在MySQL資料庫中，mysql-bin.000001、mysql- bin.000002等檔案是資料庫的操作日誌，例如UPDATE一個表，或者DELETE一些資料，即使該語句沒有匹配的資料，這個命令也會儲存到日誌檔案中，還包括每個語句執行的時間，也會記錄進去的。
這樣做主要有以下兩個目的：
1：資料恢復

如果你的資料庫出問題了，而你之前有過備份，那麼可以看日誌檔案，找出是哪個命令導致你的資料庫出問題了，想辦法挽回損失。

2：主從伺服器之間同步資料

主伺服器上所有的操作都在記錄日誌中，從伺服器可以根據該日誌來進行，以確保兩個同步。
處理方法分兩種情況：
1：只有一個mysql伺服器，關閉MySQL的日誌功能步驟：
1) 刪除日誌：
登入後執行：mysql> reset master;
2)禁用MySQL日誌：修改/etc/my.cnf 檔案，找到
log-bin=mysql-bin
binlog_format=mixed
這兩行前面加上#，將其註釋掉，再執行/etc/init.d/mysql restart即可。
如果實在想保留日誌，可以在/etc/my.cnf里加入expire_logs_days = 10 然後重啟mysql，這樣10天就會自動清理日誌。
2：如果你的環境是主從伺服器，那麼就需要做以下操作了。
A：在每個從屬伺服器上，使用SHOW SLAVE STATUS來檢查它正在讀取哪個日誌。
B：使用SHOW MASTER LOGS獲得主伺服器上的一系列日誌。
C：在所有的從屬伺服器中判定最早的日誌，這個是目標日誌，如果所有的從屬伺服器是更新的，就是清單上的最後一個日誌。
D：清理所有的日誌，但是不包括目標日誌，因為從伺服器還要跟它同步。
清理日誌方法為：
PURGE MASTER LOGS TO 'mysql-bin.010';  
PURGE MASTER LOGS BEFORE '2008-12-19 21:00:00'; 
如果你確定從伺服器已經同步過了，跟主伺服器一樣了，那麼可以直接RESET MASTER將這些檔案刪除。

詳見MySQL官網：

https://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/purge-binary-logs.html