Innodb資料庫對於已經刪除的資料只是標記為刪除，並不真正釋放所佔用的磁碟空間，這就導致InnoDB資料庫檔案不斷增長。

如果在建立資料庫的時候設定innodb_file_per_table=1，這樣InnoDB會對每個表建立一個數據檔案，然後只需要執行OPTIMIZE TABLE 命令就可以釋放所有已經刪除的磁碟空間。

執行OPTIMIZE TABLE 表名後，雖然最後會報Table does not support optimize, doing recreate + analyze instead，但其實已經成功了：）

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如果沒有設定這個引數，又想釋放空間，徹底釋放這些已經刪除的資料，需要把資料庫匯出，刪除InnoDB資料庫檔案，然後再倒入。

下面是基本的步驟：

1 使用mysqldump命令將InnoDB資料庫匯出

2 停止MySQL

3 刪除所有InnoDB資料庫檔案和日誌

4 啟動MySQL並自動重建InnoDB資料庫檔案和日誌檔案

5 匯入前面備份的資料庫檔案

# 備份資料庫：

mysqldump -uroot -proot --quick --force --all-databases > mysqldump.sql
# 停止資料庫

service mysqld stop
# 刪除這些大檔案
rm /usr/local/mysql/var/ibdata1
rm /usr/local/mysql/var/ib_logfile*
# 手動刪除除Mysql之外所有資料庫資料夾，然後啟動資料庫

service mysqld start
# 還原資料

mysql -uroot -proot < mysqldump.sql