授權協議的不同： 
openjdk採用GPL V2協議放出，而JDK則採用JRL放出。兩者協議雖然都是開放原始碼的，但是在使用上的不同在於GPL V2允許在商業上使用，而JRL只允許個人研究使用。 
OpenJDK不包含Deployment（部署）功能： 
部署的功能包括：Browser Plugin、Java Web Start、以及Java控制面板，這些功能在Openjdk中是找不到的。 
OpenJDK原始碼不完整： 
這個很容易想到，在採用GPL協議的Openjdk中，sun jdk的一部分原始碼因為產權的問題無法開放openjdk使用，其中最主要的部份就是JMX中的可選元件SNMP部份的程式碼。因此這些不能開放的原始碼將它作成plug，以供OpenJDK編譯時使用，你也可以選擇不要使用plug。而Icedtea則為這些不完整的部分開發了相同功能的原始碼(OpenJDK6)，促使OpenJDK更加完整。 
部分原始碼用開原始碼替換： 
由於產權的問題，很多產權不是SUN的原始碼被替換成一些功能相同的開原始碼，比如說字型柵格化引擎，使用Free Type代替。 
openjdk只包含最精簡的JDK： 
OpenJDK不包含其他的軟體包，比如Rhino Java DB JAXP……，並且可以分離的軟體包也都是儘量的分離，但是這大多數都是自由軟體，你可以自己下載加入。 
不能使用Java商標： 
這個很容易理解，在安裝openjdk的機器上，輸入“java -version”顯示的是openjdk，但是如果是使用Icedtea補丁的openjdk，顯示的是java。（未驗證） 
總之，在Java體系中，還是有很多不自由的成分，原始碼的開發不夠徹底，希望Oracle能夠讓JCP更自由開放一些，這也是所有Java社群所希望的。