bam2fasta的轉變方式：
samtools view input.bam | awk '{OFS="\t"; print ">"$1"\n"$10}' - > output.fasta
sam2fasta的轉變方式
cat *.sam | awk '{print ">"$1"\n"$10}' > *.fasta
檢視bam檔案 samtools view input.bam
bam檔案和sam檔案的轉換 samtools view
bam檔案轉換為fastq檔案
bam2fastq --aligned input.bam -o output.fq
bam2fasta的轉變方式： samtools view input.bam | awk '{OFS="\t"; print ">"$1"\n"$10}' - > output.fasta sam2fasta的轉變方式 cat *.sam | awk '{pri
從NCBI下載的測序資料很多是去過接頭的，並且整理成readscount格式，即每行第一列為reads，第二列為reads數，而我們需要把它整理成fasta格式，並且每個read都整理為一條序列 原始檔案： cat GSM3124755_WTB_PARE.csv | h
在NCBI下載測序資料時有很多是以reads序列 + count數的格式，這種是作者去完接頭並過濾掉低質量reads後的結果。下面實現將reads count格式轉化為fasta格式 cat reads_count.txt AAACCCGGGTTT 3 ACAAGATTAG
最近在跑SSD和Faster R-CNN深度學習程式碼，下載了一些資料集，但是這些資料集標籤檔案不是xml格式檔案，而是yaml檔案，雖然網上有線上轉化的工具，但是這種做法對我來說顯然是很低效率的。為了提高效率，自己寫了相關的程式碼。現在分享給大家。感謝Bosch Small
當前很多工具能提供mp4格式的轉換輸出，但有時輸出的格式拿到網路上後發現需要完整下載後才能開始播放，而不能像網上的很多視訊那樣一開始就能播放（邊下邊放），造成這個問題的原因是一些描述mp4檔案資訊的moov atom元資料預設放置在了視訊檔案的最後，而所有的播放器（包括獨立的、網路化的——如瀏覽器）
pyinstaller使用（win8.1系統，Python3.6） 在使用pyinstaller前先要安裝該庫，具體安裝有pip方式、通過PyCharm 安裝等，可以在CSDN上搜索相關文章，這裡不做多餘贅述。 說明一下我的情況： Python安裝在E盤，.py
對於Pcks不瞭解的可以先看下PKCS標準，然後這裡暫時只有pcks8格式轉化為pcks1格式，暫時還沒能找到直接通過BouncyCastle來轉化pcks1格式到pcks8格式的方法或程式碼（當然可以藉由RSACryptoServiceProvider來進行讀取，然後再進
----全文如下---- 關於面向中小學生的全國性競賽活動管理辦法（試行） 為規範管理面向中小學生（包含在園幼兒，下同）的全國性競賽活動，防止活動專案過多過濫，切實減輕中小學校（包含幼兒園，下同）、中小學生和家長負擔，維護正常教育教學秩序，根據中共中央辦公
由於Itext對html的轉化中，對css不是很支援，在對html進行轉化時，會發生樣式走樣的問題，這個問題任需要解決。 1）使用IText轉換 原理： 使用IText將HTML檔案轉化為PDF檔案 缺點： 對CSS樣式支援不是很好。 失真情況可能比較大 具體實
標籤： caffe 深度學習 作者：賈金讓 一.指令碼實現的功能 1.將訓練資料集轉化為lmdb格式； 2.將測試資料集轉化為lmdb格式； 3.生成mean.binaryproto檔案。 二.原理簡述 對於使用caffe的人來說，預處
update # 匯入FreeCAD 路徑為FreeCAD安裝路徑,bin檔案裡有個檔案叫 FreeCad.pyd 這是關鍵 import sys sys.path.append('C:\\Software\\FreeCAD 0.17\\bin') import FreeC
Linux下caffe中如何將自己的jpg格式的圖片轉化為lmdb格式的檔案 本文利用caffe自帶的create_imagenet.sh檔案進行轉化，具體步驟如下。 1 資料準備 將圖片資料和標註分別放好 訓練資料放在train資料夾裡，測試資料放在v
Given a positive integer, return its corresponding column title as appear in an Excel sheet. for example: 1 -> A 2 -
Windows NT 3.1引入了一種名為PE檔案格式的新可執行檔案格式。PE檔案格式的規範包含在了MSDN的CD中（Specs and Strategy, Specifications, Windows NT File Format Specifications），但是
xip 的 bin 檔案分析 一個bin 檔案在儲存上是按下面的結構儲存的 組成：標記(7)+Image開始地址(1)+Image長度(1) 記錄0地址+記錄0長+記錄0校驗和+記錄0內容(檔案內容) 記錄1地址+記錄1長+記錄1校驗和
package org.apache.flume.sink; import java.io.BufferedOutputStream; import java.io.File; import java.io.FileOutputStream; import java.io.IOException; impor
4.檔案與目錄的預設許可權與隱藏許可權1) 檔案預設許可權：umaskumask 就是檢視或指定 『目前使用者在建立檔案或目錄時候的許可權預設值』[[email protected] ~]# umask[[email protected] ~]# umask -S查閱的方式有兩種，一種可以
clc; clear; close all; list = dir('./*.pgm'); % list 為結構體陣列 for i = 1:len
1. 檔案系統樹結構 windows 分割槽 Windows 情況開始分析，硬碟會被分為多個分割槽（C 盤、D 盤 … ），每個分割槽之上會看到很多資料夾： Linux 分割槽 Linux 中分割槽不叫 C 盤、D 盤了，叫 sda1、sda2 … 但是檔案系
獲得的檔案串格式： file1/1 - sss.txt|file1/bin.zip|file2/linpanhu.docx|qmake_vc.bat|send.zip| 思路：====>>> file1/1 - sss.txt file