首先要安裝mysql驅動程式包
Step 1: 將mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar檔案拷貝到......\MATLAB\R2009a\java\jar\toolbox   (...表示在你自己的MATLAB檔案安裝路徑下尋找，5.1.7代表版本，無要求）
Step 2: 到......\MATLAB\R2009a\toolbox\local目錄下，找到classpath.txt檔案，開啟，並新增用來載入mysql的jdbc驅動語句：
$matlabroot/java/jar/toolbox/mysql-connector-java-5.1.7-bin.jar（對應自己下載的驅動版本名稱）
Step 3:重新開啟MATLAB即可

驅動程式安裝成功後，接來下要是matlab連線mysql資料庫的程式碼：
conn =database('databasename','username','password','driver','databaseurl')
連線成功後，返回連線物件。
引數如下：
*databasename: 資料庫名稱.
*driver: JDBC driver.
*username and password: 使用者名稱和密碼.
*databaseurl: 類似於jdbc:subprotocol:subname. subprotocol 是資料庫型別,
subname 類似於//hostname:port/databasename.
如果matlab和資料庫建立了連線，將返回類似於如下資訊：
Instance: 'SampleDB'
UserName: ''
Driver: []
URL: []
Constructor: [1x1 com.mathworks.toolbox.database.databaseConnect]
Message: []
Handle: [1x1 sun.jdbc.odbc.JdbcOdbcConnection]
TimeOut: 0
AutoCommit: 'off'
Type: 'Database Object'
連線mysql的程式碼如下：
conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi'); 
連線成功後，就可以用exec函式執行sql語句
exec函式執行sql語句並返回一個開指標
語法如下：
curs = exec(conn,'sqlquery')
例如：curs = exec(conn, 'select * from customers')
執行完查詢後，還要將查詢結果從開放cursor物件匯入到物件curs中，該功能是用
cursor.fetch函式實現的。
語法如下：
curs = fetch(curs)
使用curs.Data來顯示資料，curs.Data返回一個CELL結構，可以先把CELL結構轉換成
MATRIX結構再取值：
cur =cell2mat(cur)
a=cur(1,1);
則查詢結果就加到了向量a中

注意：
在exec函式執行查詢過程中，有的sql語句要輸入變數，這時可使用strcat函式完成該
功能。
t = strcat(s1, s2, s3, ...)
for(t=1:10)
sql1 = strcat('select count(did) from rss_genepairs_u where gocc>=',num2str(t),' || gomf >= ',num2str(t),' || gobp >= ',num2str(t));
end
完整程式碼如下： 
conn = database('tissueppi','root','root','com.mysql.jdbc.Driver','jdbc:mysql://localhost:3306/tissueppi');
for t=0.5:0.01:0.91
for x=0.5:0.1:11
sql = strcat('select count(did) from rss_genepairs_x2 where score <=',num2str(x),' and did in(select did from rss_genepairs_u where gocc >=',num2str(t),' || gomf >= ',num2str(t),' || gobp >= ',num2str(t),')');
aTemp = exec(conn,sql);
aTemp = fetch(aTemp);
a = aTemp.Data;
a = cell2mat(a);
a= a(1,1);
end
end

轉自：https://zhidao.baidu.com/question/1369639103509821099.html