AVR微控制器時鐘有三種模式：
1、內部時鐘源，可分為內部晶振和外部晶振，用的是微控制器內部的振盪電路。內部晶振可以設定1M、2M、4M、8MHz晶振頻率，外部可支援到16MHz（MEGA16或者MEGA16A）MEGA16L可支援最高8MHz的外部晶振（通過熔絲設定）。
2、外部時鐘源，靠外部振盪電路提供時鐘，可以用外部同步時鐘訊號（如用其他微控制器提供時鐘）或者外部振盪器（如有源晶振）將此訊號接到微控制器XTAL1埠，熔絲設定為外部時鐘即可（不是外部晶振）。
3、設定晶振熔絲錯誤會導致晶片鎖死，如果設定為外部晶振，直接加晶振即可解除，設定為外部時鐘源，那隻好提供外部時鐘才能解除（有源晶振）。