柳葉刀發表的文獻解讀：Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

背景介紹

• 隨著超聲波在產科護理中的應用，胎兒結構異常的鑒別已成為例行公事。當發現異常時，進一步評估核型、全染色體非整倍體與染色體微陣列（CMA）上較小的微缺失和復制（CNV），則是非常的重要。目前研究發現，大約32%結構異常胎兒具有臨床相關的異常核型，6%的結構異常胎兒能找到致病的CNV，這意味著超過60%的孕婦沒有明確的基因組診斷方法作為胎兒結構異常的遺傳咨詢以及指導。
• 當核型檢測和染色體微陣列檢測均為陰性時，可通過全外顯子測序（WES）可診斷無法解釋的假定遺傳性疾病（如出生缺陷），診斷率在25-35%。
• 目前為止，只有案例系列評價了孕期應用WES的可行性和價值診斷，盡管數據有限，實驗室和臨床醫生已經開始提供產前WES作為評估胎兒畸形的臨床護理。

研究方法

• 234 個胎兒結構異常的三口之家被納入研究（孕11-35周）。

• 排除核型異常和染色體微陣列異常的胎兒。

• 排除父母、胎兒DNA數據缺失的樣本。

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結果

• 全外顯子測序結果：

• 71 (14%) 對父母拒絕參與該項研究，87 (17%) 的家庭缺乏其中一位的DNA數據，69 (13%) 個胎兒存在核型異常和染色體微陣列異常，51 (10%) 個家庭撤回研究，5(1%)個家庭質量不過關，沒法分析，被排除。

• 新突變韋恩圖結果：

• 產生258個假定的（還沒驗證）新突變，藍色為具有生物學意義的新突變，紅色為致病性的新突變

  

• 不同異常器官的突變分布：淋巴（24%）異常、骨骼（24%）異常、中樞神經（22%）異常和腎臟（16%）異常的胎兒突變比較多，心臟異常的胎兒突變較少。

  

本文亮點：

• 第一次大規模的進行了胎兒結構異常的三口之家的全外測序研究；

• 第一次用大數據的結果顯示，當核型和染色體微陣列正常的情況下，全外顯子測序只能解釋10%的胎兒結構異常案例；

原文出處：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0140673618320427

柳葉刀重磅出擊！全外顯子測序在胎兒結構異常的評估Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study