第三代基因測序技術革新 雲計算的應用
阿新 • • 發佈：2019-02-25
打通 等等 高速公路 個人 獲得 能力 雲端 減少 計算 第三代基因測序技術革新 雲計算的應用
一位準媽媽，在懷孕12-24周時，需要做唐氏兒的篩查，傳統唐篩的方式準確率低，如果結果顯示危險性高，那麽準媽媽還需要做羊膜穿刺等進一步檢查。
而今天，隨著基因測序技術的發展，我們可以通過無創DNA檢測的方式，利用DNA測序對母體外周血漿中的遊離DNA片段進行測序，並將測序結果進行生物信息分析，可以從中得到胎兒的遺傳信息，從而實現對唐氏兒的精準篩查。
結合DNA在轉錄蛋白質時的對應關系以及不同蛋白質對人體的作用，科學家們已經可以從DNA中解讀關於人類健康及遺傳的很多信息。這其中就包括後代出現某些遺傳缺陷的幾率，某種疾病在個體上發生的概率，個體對某些藥物或食物的潛在過敏反應等等。
基因測序領域中的IT挑戰
最新的第三代基因測序儀不僅測得更準，更可以大幅降低基因測序的成本。現在，即便是普通家庭也可以幾乎沒有經濟負擔的完成一次基因測序。而基因測序已經成為中國人關註健康，提升生活品質的流行手段。
個人基因測序市場規模的擴展讓未來組的業務在短短幾年中取得了飛速的進展。目前，未來組已經發展為國內最大的第三代基因測序公司。
不過蓬勃發展的個人基因測序業務和大量的科研工作也讓未來組的IT設施受到了巨大的挑戰。
未來組目前已經擁有兩臺第三代基因測序儀，而未來這一數字將增長至五臺。基於現有的業務增長速率，這意味著僅在個人基因測序業務中，每天的數據產生量就高達300TB至600TB。
可以說任何本地系統的擴容速度都無法追上這種規模的數據增長。唯一的出路只有雲!
華為以全面IT技術助力健康新時代
經過反復比對和考察，未來組最終選擇將華為雲作為未來存儲的主陣地。
同時，武漢未來組生物科技有限公司IT中心總監朱贏也表示：在探索基因測序數據雲端存儲方法的過程中，華為雲提供了非常完善的技術支持服務。而華為雲在業務上的響應速度也是未來組所有接觸過的雲服務商中最快的。這讓未來組與華為之間建立起了非常好的合作和信任關系。
不僅如此，未來組還正與華為在更多領域開展聯合探索：
在一個名為“華夏萬人SV”的基因測序計劃中，樣本數量達到了空前的一萬個。使用現有系統，每個樣本都需要至少360個核小時來將DNA片段重組為完整的DNA序列，這意味著整個項目需要將近400萬核小時的時間來完成計算。而通過使用華為提供的100臺32核心高性能服務器進行72小時滿負荷測試，整個DNA片段重組需4萬個核小時就可以完成全部計算工作，效率提升100倍。
同時，未來組還在積極嘗試利用華為昆侖小型機產品所具備的海量內存來提升DNA片段重組計算任務的運行效率。
朱贏表示：未來，未來組還會嘗試使用華為雲所提供的異構計算服務來加速DNA片段重組的計算工作，並結合容器技術來進一步提升效率。基於華為雲，未來組還將開發一套面向基因測序分析報告的移動APP，讓用戶可以更方便、更快速的調取基因測序結果，獲得更好的用戶體驗。
有人說基因工程和生物科技很可能是第四次工業革命的主要方向，而現在，我們正站在這場革命的門口。
寫在最後，筆者認為隨著生命科學領域的全面發展以及數據中心的全面雲化，生命科學行業雲化發展是大勢所趨。雲計算的到來，使數據以及計算全部可以在雲上完成，滿足企業數據不下雲，高效完成企業的計算需求，減少企業重資產以及維護的工作，使客戶更聚焦在自身的業務發展上。
在基因測序領域，以數據分析、雲計算為主導的IT技術已經成為驅動行業創新、變革的重要因素。快速的技術革新和應用，使得醫生可以基於病患的基因信息、生活環境和生活方式，提供更為精準的診斷和治療。通過強大的資源、完整而先進的產品組合以及強大的服務能力，華為以及華為雲正在為未來組這樣的生物科技公司鋪就一條混合IT的高速公路，讓更健康、更美好的未來能夠盡快到來。
想學習更多雲計算的起源及應用，歡迎到華為雲學院免費學習，課程獲取密鑰：
（ https://edu.huaweicloud.com/courses/ ）搜索華為雲入門即可獲取！
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而今天，隨著基因測序技術的發展，我們可以通過無創DNA檢測的方式，利用DNA測序對母體外周血漿中的遊離DNA片段進行測序，並將測序結果進行生物信息分析，可以從中得到胎兒的遺傳信息，從而實現對唐氏兒的精準篩查。
結合DNA在轉錄蛋白質時的對應關系以及不同蛋白質對人體的作用，科學家們已經可以從DNA中解讀關於人類健康及遺傳的很多信息。這其中就包括後代出現某些遺傳缺陷的幾率，某種疾病在個體上發生的概率，個體對某些藥物或食物的潛在過敏反應等等。
基因測序領域中的IT挑戰
最新的第三代基因測序儀不僅測得更準，更可以大幅降低基因測序的成本。現在，即便是普通家庭也可以幾乎沒有經濟負擔的完成一次基因測序。而基因測序已經成為中國人關註健康，提升生活品質的流行手段。
個人基因測序市場規模的擴展讓未來組的業務在短短幾年中取得了飛速的進展。目前，未來組已經發展為國內最大的第三代基因測序公司。
不過蓬勃發展的個人基因測序業務和大量的科研工作也讓未來組的IT設施受到了巨大的挑戰。
未來組目前已經擁有兩臺第三代基因測序儀，而未來這一數字將增長至五臺。基於現有的業務增長速率，這意味著僅在個人基因測序業務中，每天的數據產生量就高達300TB至600TB。
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同時，未來組還在積極嘗試利用華為昆侖小型機產品所具備的海量內存來提升DNA片段重組計算任務的運行效率。
朱贏表示：未來，未來組還會嘗試使用華為雲所提供的異構計算服務來加速DNA片段重組的計算工作，並結合容器技術來進一步提升效率。基於華為雲，未來組還將開發一套面向基因測序分析報告的移動APP，讓用戶可以更方便、更快速的調取基因測序結果，獲得更好的用戶體驗。
有人說基因工程和生物科技很可能是第四次工業革命的主要方向，而現在，我們正站在這場革命的門口。
寫在最後，筆者認為隨著生命科學領域的全面發展以及數據中心的全面雲化，生命科學行業雲化發展是大勢所趨。雲計算的到來，使數據以及計算全部可以在雲上完成，滿足企業數據不下雲，高效完成企業的計算需求，減少企業重資產以及維護的工作，使客戶更聚焦在自身的業務發展上。
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