(轉)python中調用R語言通過rpy2 進行交互安裝配置詳解
python中調用R語言通過rpy2 進行交互安裝配置詳解(R_USER、R_HOME配置)
2018年11月08日 10:00:11 luqin_ 閱讀數:753python中調用R語言通過rpy2 進行詳解
文章目錄
- python中調用R語言通過rpy2 進行詳解
- 1.R語言的安裝:
- 2.Rpy2工具的安裝和配置
- 3.pycharm中使用R語言配置
1.R語言的安裝:
大家進行R語言的安裝,在安裝好R後,需要配置環境變量R才能進行使用。
對此電腦右鍵->選擇高級設置->環境變量->PATH->編輯:
然後進行環境變量的編輯,這裏我們在環境變量中加上R的安裝路徑:
這是我們使用管理者打開:輸入R;即可:
出現如上界面代表R語言安裝成功。這是R與python進行交互的第一步.
2.Rpy2工具的安裝和配置
首先可以使用 pip install rpy2
如果不行就使用源代碼安裝,先去下載源,https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/ 打開這個網址,按ctrl+F搜索Rpy2,就會出現以下界面:
這裏可以根據python版本,和電腦屬性進行選擇你需要的rpy2源。進入到rpy2的文件路徑下:使用 pip進行安裝即可。前提是 python安裝成功,且python 環境變量已配置好。查看是否安裝成功 就到 python安裝路徑下Lib文件中的site_packages 中是否有rpy2。或者可用pip freeze 進行查看是否安裝成功。
或將whl文件解壓縮,並將文件夾拷貝到site_packages目錄下,然後在pycharm中設置——project interpreter——安裝rpy2
3.pycharm中使用R語言配置
以上都安裝好了,但是在pycharm中使用R的時候仍會報錯,R_User not defined 這時我們還需要進行R_USER與R_HOME語言的環境變量配置.
在用戶變量中增加R_USER、R_HOME
R_HOME:指向R安裝路徑,R_USER指向rpy2的路徑。
也就是說一共要設置三個:首先在PATH裏加上R的安裝路徑,其次是Rpy2的安裝,最後是R_USER、R_USER設置。博主是在RPY2安裝之後可以導入以為就可以成功使用了,結果在Pycharm中一直報各種錯誤,然後不斷的該變量的路徑,重啟電腦才將R_USER、R_HOME配置成功,因為網上的說法都不一樣,唉,弄得心累 ,所以一定要記載一下!!!
如果還是不行,直接在代碼裏指定R_USER
os.environ[‘R_USER‘]=‘C:/Program Files/Python37/Lib/site-packages/rpy2‘
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