MySQL資料庫監控軟體lepus使用問題以及解決辦法

MySQL · 發表 2018-10-16 22:01:42

摘要：在使用lepus3.7監控MySQL資料庫的時候，碰到了以下幾個問題，本部落格給出了這些問題產生的原因，以及相應的解決辦法。 1. 問題1：php頁面無法連線資料庫直接使用php程式執行php檔案，可以連線mysql，但是在httpd中同樣的php頁面無法連線mysql。 lepus的...

在使用lepus3.7監控SQL/">MySQL資料庫的時候，碰到了以下幾個問題，本部落格給出了這些問題產生的原因，以及相應的解決辦法。

1. 問題1：php頁面無法連線資料庫

直接使用php程式執行php檔案，可以連線mysql，但是在httpd中同樣的php頁面無法連線mysql。

lepus的web程式(PHP程式碼)無法連線資料庫時，web介面上什麼操作也無法繼續。

為此編寫了最簡單的PDO連線測試程式碼：

php程式碼如下：

[linuxidc@linuxidc lepus]$ cat mysql.php

<?php

try{

#$dsn="mysql:host=127.0.0.1;dbname=lepus;";

$dsn="mysql:host=11.1.1.11;dbname=lepus;";

$user="coe2coe";

$pwd="XXXXXXXXXX";

$sql="select now() as a";

$dbh=new PDO($dsn,$user,$pwd);

$stmt=$dbh->prepare($sql);

$stmt->execute();

$row=$stmt->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);

echo "result:".$row['a'];

}

catch(PDOException $e) {

echo "FAILED:".$e->getMessage();

}

php程式直接執行php檔案：

[linuxidc@linuxidc lepus]$ php mysql.php

result:2018-09-27 00:03:44

通過瀏覽器訪問這個頁面：

FAILED:SQLSTATE[HY000] [2003] Can't connect to MySQL server on '11.1.1.11' (13)

lepus的web程式給出的錯誤提示資訊更加模糊。

原因：

通過一番baidu之後，終於看到了一個比較靠譜的分析。

Linux(CentOS7)的selinux安全機制禁止了httpd中的模組訪問網路。

[linuxidc@linuxidc lepus]$ sudo getsebool -a |grep httpd

httpd_anon_write --> off

httpd_builtin_scripting --> on

httpd_can_check_spam --> off

httpd_can_connect_ftp --> off

httpd_can_connect_ldap --> off

httpd_can_connect_mythtv --> off

httpd_can_connect_zabbix --> off

httpd_can_network_connect --> off

httpd_can_network_connect_cobbler --> off

httpd_can_network_connect_db --> off

httpd_can_network_memcache --> off

httpd_can_network_relay --> off

httpd_can_sendmail --> off

httpd_dbus_avahi --> off

httpd_dbus_sssd --> off

httpd_dontaudit_search_dirs --> off

httpd_enable_cgi --> on

httpd_enable_ftp_server --> off

httpd_enable_homedirs --> off

httpd_execmem --> off

httpd_graceful_shutdown --> on

httpd_manage_ipa --> off

httpd_mod_auth_ntlm_winbind --> off

httpd_mod_auth_pam --> off

httpd_read_user_content --> off

httpd_run_ipa --> off

httpd_run_preupgrade --> off

httpd_run_stickshift --> off

httpd_serve_cobbler_files --> off

httpd_setrlimit --> off

httpd_ssi_exec --> off

httpd_sys_script_anon_write --> off

httpd_tmp_exec --> off

httpd_tty_comm --> off

httpd_unified --> off

httpd_use_cifs --> off

httpd_use_fusefs --> off

httpd_use_gpg --> off

httpd_use_nfs --> off

httpd_use_openstack --> off

httpd_use_sasl --> off

httpd_verify_dns --> off

解決辦法：

臨時辦法：臨時禁用SELINUX。

[linuxidc@linuxidc lepus]$ sudo setenforce 0

永久辦法：修改selinux配置檔案，禁用SELINUX。

[linuxidc@linuxidc lepus]$ cat /etc/selinux/config

# This file controls the state of SELinux on the system.

# SELINUX= can take one of these three values:

# enforcing - SELinux security policy is enforced.

# permissive - SELinux prints warnings instead of enforcing.

# disabled - No SELinux policy is loaded.

#SELINUX=enforcing

SELINUX=disabled

# SELINUXTYPE= can take one of three two values:

# targeted - Targeted processes are protected,

# minimum - Modification of targeted policy. Only selected processes are protected.

# mls - Multi Level Security protection.

SELINUXTYPE=targeted

驗證：

再次在瀏覽器中訪問這個php頁面：

result:2018-09-27 00:09:26

2. 問題2：lepus日誌中出現group by警告。

2018-09-27 01:12:41 [WARNING] check mysql 11.1.1.11:3408 failure: 1055 Expression #2 of SELECT list is not in GROUP BY clause and contains nonaggregated column 'information_schema.processlist.USER' which is not functionally dependent on columns in GROUP BY clause; this is incompatible with sql_mode=only_full_group_by

原因：

這是lepus後端監控程式寫的log。

預設情況下sql_mode包含ONLY_FULL_GROUP_BY。

mysql> select @@sql_mode;

+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+

| @@sql_mode |

+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+

| ONLY_FULL_GROUP_BY,STRICT_TRANS_TABLES,NO_ZERO_IN_DATE,NO_ZERO_DATE,ERROR_FOR_DIVISION_BY_ZERO,NO_AUTO_CREATE_USER,NO_ENGINE_SUBSTITUTION |

+-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+

1 row in set (0.01 sec)

解決辦法：

去掉ONLY_FULL_GROUP_BY。

sql_mode=STRICT_TRANS_TABLES,NO_ZERO_IN_DATE,NO_ZERO_DATE,ERROR_FOR_DIVISION_BY_ZERO,NO_AUTO_CREATE_USER,NO_ENGINE_SUBSTITUTION

3. 問題3：複製監控查詢不到資料。

沒有查詢到資料.

解決辦法：

show_compatibility_56=1

4. 問題4：表空間分析沒有資料。

5. 問題5:慢查詢沒有資料。

前提：

MySQL的my.cnf配置檔案中已經配置了慢查詢日誌。

slow_query_log=1

long_query_time=10

log_slow_admin_statements=1

log_slow_slave_statements=1

原因：

1.lepus慢查詢分析基於pecona-toolkit工具包中的pt-query-digest程式。需要先安裝這個工具包。

2. pt-query-digest程式與lepus3.7建的表有點衝突。

Pipeline process 5 (iteration) caused an error: DBD::mysql::st execute failed: Data truncated for column 'checksum' at row 1 [for Statement "REPLACE INTO `lepus`.`mysql_slow_query_review_history`(`checksum`, `sample`, `serverid_max`, `db_max`, `user_max`, `ts_min`,

.....

Terminating pipeline because process 4 (iteration) caused too many errors.

修改mysql_slow_query_review：

mysql> alter table mysql_slow_query_review modify checksum varchar(100) not null ;

Query OK, 0 rows affected (0.03 sec)

Records: 0 Duplicates: 0 Warnings: 0

修改mysql_slow_query_review_history:

mysql> alter table mysql_slow_query_review_history modify checksum varchar(100) not null;

Query OK, 0 rows affected (0.02 sec)

Records: 0 Duplicates: 0 Warnings: 0

mysql> alter table mysql_slow_query_review_history modify serverid_max smallint(4) null;

Query OK, 0 rows affected (0.02 sec)

Records: 0 Duplicates: 0 Warnings: 0

修改指令碼：

原始的lepus_slowquery.sh檔案存在一些問題。

(1) 需要人工指定lepus_server_id。這個指令碼需要在每個MySQL伺服器上部署，因此如果要監控的MySQL很多，會比較容易出錯。

lepus_server_id這個引數很重要。下面的程式碼可以自動取得這個id。

id=$( $mysql_client -h$lepus_db_host -P$lepus_db_port -u$lepus_db_user -p$lepus_db_password -e "select id,host,port from $lepus_db_database.db_servers_mysql where host='$mysql_host' and port=$mysql_port\G" 2>/dev/null |grep "id:" |awk -F": " '{print $2}')

(2）同一臺機器上如果部署有多個MySQL服務例項時，應該只需要一個定時任務即可，在另一指令碼中同時對本機的多個MySQL服務例項進行檢查。

這個總的定時指令碼如下,測試時開啟了6個MySQL例項,埠依次為：3306 3307 3308 3406 3407 3408.其中3306和3406為MASTER，其它為SLAVE。在這個總的指令碼中對每個例項呼叫lepus_slowquery.sh。

[linuxidc@linuxidc mysql]$ cat slowquery.sh

##################################################################

# FileName ：slowquery.sh

# Author : [email protected]

# Created ：2018-09-27

# Description ：http://www.cnblogs.com/coe2coe/

#################################################################

#!/bin/bash

ports=(3306 3307 3308 3406 3407 3408)

i=0

while [ $i -lt ${#ports[*]} ]

port=${ports[$i]}

echo -e "/lepus_slowquery.sh $port"

./lepus_slowquery.sh $port

let i=i+1

done

(3)原始的lepus_slowquery.sh會去修改MySQL的全域性配置引數，個人認為不需要修改，這兩個配置還是應該按照MySQL伺服器的my.cnf檔案中配置的為準,不應該因為部署了一個lepus監控系統就隨意的修改這個引數。因此直接註釋掉了最後面的幾行程式碼。

long_query_time

slow_query_log_file

修改後的完整的lepus_slowquery.sh檔案如下：

[linuxidc@linuxidc mysql]$ cat lepus_slowquery.sh

#!/bin/bash

#****************************************************************#

# ScriptName: /usr/local/sbin/lepus_slowquery.sh

# Create Date: 2014-03-25 10:01

# Modify Date: 2014-03-25 10:01

#***************************************************************#

port=$1

id=$2

if [ "$port" == "" ] || [ $port -lt 1 ]

then

echo -e "invalid argument port"

exit 1

echo -e "mysql port is :{$port} "

#config lepus database server

lepus_db_host="11.1.1.11"

lepus_db_port=3306

lepus_db_user="lepus_monitor"

lepus_db_password="XXXXXXXXXX"

lepus_db_database="lepus"

#config mysql server

mysql_client="/usr/bin/mysql"

mysql_host="11.1.1.11"

mysql_port=$port

mysql_user="lepus_monitor"

mysql_password="XXXXXXXXXX"

if [ "$id" == "" ] || [ $id -lt 1 ]

then

echo -e "invalid argument id"

exit 2

echo -e "mysql lepus id is :{$id}"

#config slowqury

slowquery_dir="/tmp/"

slowquery_long_time=1

slowquery_file=`$mysql_client -h$mysql_host -P$mysql_port -u$mysql_user -p$mysql_password -e "show variables like 'slow_query_log_file'" 2>/dev/null |grep log|awk '{print $2}'`

pt_query_digest="/usr/bin/pt-query-digest"

#config server_id

lepus_server_id=$id

#collect mysql slowquery log into lepus database

$pt_query_digest --user=$lepus_db_user --password=$lepus_db_password --port=$lepus_db_port --review h=$lepus_db_host,D=$lepus_db_database,t=mysql_slow_query_review --history h=$lepus_db_host,D=$lepus_db_database,t=mysql_slow_query_review_history --no-report --limit=100% --filter=" \$event->{add_column} = length(\$event->{arg}) and \$event->{serverid}=$lepus_server_id " $slowquery_file > /tmp/lepus_slowquery.log

##### set a new slow query log ###########

#tmp_log=`$mysql_client -h$mysql_host -P$mysql_port -u$mysql_user -p$mysql_password -e "select concat('$slowquery_dir','slowquery_', '$port','_', date_format(now(),'%Y%m%d%H'),'.log');" 2>/dev/null |grep log|sed -n -e '2p'`

#config mysql slowquery

#$mysql_client -h$mysql_host -P$mysql_port -u$mysql_user -p$mysql_password -e "set global slow_query_log=1;set global long_query_time=$slowquery_long_time;" 2>/dev/null

#$mysql_client -h$mysql_host -P$mysql_port -u$mysql_user -p$mysql_password -e "set global slow_query_log_file = '$tmp_log'; "

#delete log before 7 days

#cd $slowquery_dir

#/usr/bin/find ./ -name 'slowquery_*' -mtime +7|xargs rm -rf ;

####END####

6. 問題6：web慢查詢查詢不到lepus中的資料

在mysql_slow_query_review表中記錄了慢查詢，但是在lepus web介面上沒有資料。

執行：select sleep(14)有時候無法在web介面查詢到。

原因：有時候pt-query-digest產生的結果中db_max為NULL，導致查詢不出來。

這個欄位安裝的原始資料庫是NOT NULL，但是在NOT NULL的情況下pt-query-digest有時會插入NULL資料，導致報錯。所以修改為了NULL。

修改為NULL後，web介面中查詢時使用的PHP程式的SQL語句有問題，沒有考慮NULL的情況，導致查詢不出來這部分資料。

解決辦法：

臨時開啟general_log這個全域性引數，再做web查詢慢日誌，就可以很快找到這個SQL語句，再根據這個SQL語句就可以找到有問題的PHP程式碼。

將 application/controllers/lp_mysql.php中的以下語句註釋掉即可。

修改前：

$this->db->where( "b.db_max !=", 'information_schema'");

修改後：

//$this->db->where( "b.db_max !=", 'information_schema'");

7. 問題7：主機監控中的三項都沒有資料。

原因：監控主機以及被監控主機上沒有安裝snmpd，snmptrapd。

解決辦法：

在所有主機上安裝snmpd和snmptrapd。

軟體包：

[linuxidc@linuxidc snmp]$ ls net-snmp*

net-snmp-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

net-snmp-agent-libs-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

net-snmp-devel-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

net-snmp-libs-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

net-snmp-perl-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

net-snmp-Python-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

net-snmp-sysvinit-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

net-snmp-utils-5.7.2-32.el7.x86_64.rpm

CentOS7-everything-xxx.iso上有這些軟體包。

安裝完畢後啟動snmpd和snmptrapd服務。

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