生物工程巨頭1 CellBio與Partek合作，開發單細胞分析inDrop系統

動脈網（公眾號：vcbeat）獲悉，單細胞分析巨頭1 Cellbio和頂尖的生物資訊軟體公司Partek昨日合作釋出了資料分析管道inDrop系統，它能順利地在Partek Flow生物資訊軟體中執行。

該系統允許使用者預處理原始的inDrop單細胞RNA-Seq資料，並使用Partek旗下先進的統計軟體和視覺化工具來描述和分析單個細胞。此外，有能力開發自定義inDrop應用程式的使用者可以利用軟體中提供的各種單細胞生物資訊學工具，並使用直觀的介面對其進行配置。

Partek旗下的單細胞RNA-Seq系統正在徹底改變複雜組織和疾病的研究，其視覺化的特點和易於操作的指令工具使研究人員能夠分析他們自己的單細胞RNA-Seq資料。首先，系統頁面會使用互動式圖表執行條形碼和細胞過濾，以指導使用者的後續選擇操作。其次，系統會自動疊加聚類結果、基因和途徑表達、樣本屬性等，以幫助對3D t-SNE圖上的細胞進行分類。最後，系統會自動識別細胞型別之間或治療條件之間差異表達的基因和途徑，有效節省研究人員的時間和精力。

Partek Flow功能介紹頁面

單細胞分析在生命科學界越來越受歡迎，併為生物工程和疾病治療提供新穎的見解。它可用於多種應用，包括腫瘤分析、藥物靶標驗證、細胞間變異鑑定和譜系示蹤。然而，生物資訊學分析仍然是許多研究人員的難題，現有的傳統解決方案已不能滿足與日俱進的研究和應用需求。生物學界想要有所突破，就需要借用先進的計算機技術和內部資訊學能力來彌補傳統方案的不足。

現在，Partek Flow通過直觀的點選介面使科學家能夠輕鬆分析其scRNA-Seq資料，從而解決了這一問題。

當被問及合作伙伴關係時，Partek總裁Tom Downey表示：“與1CellBio合作的意義在於，我們為分析單細胞資料提供一種經濟上負擔得起且易於使用的解決方案，讓科學家無需學習和使用過於專業的計算機技術就能嘗試解決自己提出的研究問題。”

1CellBio執行長Colin J.H. Brenan博士則表示：“他們不僅提供一流的scRNA-seq分析解決方案，隨著我們引入更多的單細胞應用，他們還將不斷地革新現有技術來滿足我們的需求。”

關於Partek

Partek總部位於密蘇里州聖路易斯，是一家為生命科學領域開發並分析軟體和技術服務的公司。其產品在所有一代測序和微陣列平臺方面皆是領先地位，超過7000篇同行評審的科學論文使用Partek軟體簡化了基因組研究的分析。Partek在推動生命科學研究方面可謂功不可沒。

關於1Cellbio

1CellBio是一家全球領先的單細胞分析公司，深耕生物醫學研究領域。1CellBio由哈佛大學的頂尖科學家建立，總部位於馬薩諸塞州劍橋市。

1CellBio的旗艦產品inDrop™系統是具有高解析度的單細胞轉錄組的平臺，在行業領域內無出其右。目前，世界各地的研究實驗室正在採用該平臺進行廣泛的單細胞應用，從腫瘤分析到幹細胞，從胚胎髮育到新藥靶點的識別和驗證。