騏驥生物聯手質譜巨頭Waters，推出組學和臨床資料場景化分析利器
動脈網（微信號：vcbeat）獲悉，2018年9月9日，由北京騏驥生物技術有限公司（簡稱“騏驥生物”）和沃特世科技（上海）有限公司（簡稱“Waters”）主辦的Qi MetA軟體全球釋出會在北京舉辦。來自臨床、科研和投資等多領域的50餘人參加了此次活動。
釋出會現場
隨著多層次的組學包括代謝組學的研究展開，高通量的資料收集已經可以實現，但是與其他的組學學科相似，代謝組學的資料分析仍是難題，尤其是資料到底意味著什麼。因此資料的挖掘以及場景化分析，已經成為各領域學者和使用者面對生物學研究，特別是代謝組學研究的最大瓶頸。
基於此，騏驥生物攜手Waters歷經3年，推出適用於組學和臨床資料的一站式分析的軟體Qi MetA。據悉，該軟體已具備完全商業化的客戶端和分析平臺。
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強強聯手，助力質譜資料分析
騏驥生物是國內領先的以代謝病研究為核心的國家高新技術公司，擁有兩個醫學檢驗所，一個科研中心，一個大資料中心。公司致力於用現代生物技術和機器學習技術解決代謝病的早期檢測與臨床診斷，發現和驗證臨床標誌物與模型，進行臨床檢驗、體外診斷和大資料分析，實現精準醫療，開啟人類健康未來。公司現已與北大、清華、中科院、三甲醫院等100多家單位建立了合作，也與國內外的知名公司建立了深度合作。
Waters公司作為國際色譜和質譜的領導者，一直專注於為實驗室相關機構開發和生產先進的分析和材料科學技術。60年來，公司開發出一系列分離科學、實驗室資訊管理、質譜分析和熱分析技術。Waters為高通量資料提供創造工具，同時也致力於推動資料分析和挖掘手段的不斷更新和進步。
此次，騏驥生物與Waters強強聯手推出Qi MetA軟體，旨在服務全球更多的使用者，並推動質譜資料分析更高效、更準確、更便捷，建立標準化的資料分析流程。
騏驥生物董事長 王文軍
騏驥生物董事長王文軍表示，多年前在工作中遇到了很多資料分析問題，但沒有一款產品能夠解決所有問題。Qi MetA軟體能夠提供一站式資料分析，一步法資料前處理方案，常用統計分析全覆蓋，提供貼合場景的視覺化方案。騏驥生物已經成立5年多了，從科研服務走到臨床服務，目前已建立兩所醫療診斷所。未來騏驥生物還將在這方面做更多的拓展性工作，讓軟體增加更多的功能，更深入、更廣泛的挖掘資料之間的價值，連結資料與業務之間的關係，讓資料真正服務於人類的健康。
Waters公司臨床市場部高階經理 譚曉傑
Waters公司臨床市場部高階經理譚曉傑也表示，Waters與騏驥生物已經是多年的老朋友了，不僅積累了友誼，也積累了大量合作和實戰的經驗。現在，健康中國2030是整個國家的主題，隨著逐漸進入老齡化社會，糖尿病等慢性病人群已達到1.17億，60歲以上人口達2.7億，大病、慢病給家庭成員的健康帶來了威脅和挑戰。Waters一直致力於色譜和質譜的研究，在軟體方面也有投入，單一指標對於疾病的描述是遠遠不夠的，在液質聯用領域，一個樣品能夠生成幾萬個資料，解析幾萬個資料又變的很複雜。
與騏驥生物的合作過程中，大資料的處理能力在這個新的Qi MetA軟體上又進一步得到了提升，這個產品的特點在原有的基礎上更加貼近本地化的場景，相信這個軟體在未來不斷迭代的過程中，一定會更精準的治療，而且視覺化程度更強，給出非常漂亮的答卷。
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關於Qi MetA軟體
騏驥生物的陳顯揚博士對新產品——Qi MetA軟體進行詳細介紹。他表示，基因測序以及質譜分析作為能解釋“這是什麼”的兩大工具已經深入到科學研究，特別是生物學研究的各個領域。騏驥公司的資料團隊貼近質譜應用場景，研究質譜使用者的使用邏輯，開發出了Qi MetA資料分析軟體，不僅符合生物學分析人員的需求，也無縫對接Waters的代謝組學工作和Progenesis QI軟體，形成一站式分析平臺。
騏驥生物 陳顯揚博士
Qi MetA是一個視窗化的資料處理和分析軟體, 應用於代謝組學和臨床資料的分析，但功能也可以擴充套件到生物學資料分析和視覺化的多個方面。適合於一站式代謝組學分析、臨床資料分析分析，以及單獨的生物學專案分析。它獨有的特點和功能主要包括：
第一，可以直接應用沃特世公司Progenesis QI軟體匯出的資料，直接進行處理，獲得可供分析的標準化資料；自動進行以QC為標準的資料篩選，包括0值篩選，CV篩選和LOESS迴歸。並自動提供QC的PCA以及樣本+QC的PCA分佈；
第二，軟體不僅可以獲得單因素下兩組資料差異分析所有統計學指標，更可以進行n組的比較，得到整組的p值以及組間的p值；
第三，Qi MetA針對單變數進行迴歸分析，同時可以批量針對所有變數進行R2篩選；使用HMDB和Lipidmaps全庫，對鑑定的化合物進行分類和比例變化分析；
第四，軟體提供單/多組（偏）最小二乘法判別分析(O)PLS-DA的快速切換；(O)PLS-DA 提供permutation結果以及cross-validation功能；通過Vip、p value、fold、fdr引數閾值設定，一步法獲得潛在生物標誌物；
第五，在軟體中，可以自動或者手動快速建立：邏輯迴歸（logical regression），決策樹（decision tree）,隨機森林（random forest），Bagging，支援向量機（support vector machine）以及GBM（gradient boosting machine）模型；自動或者手動給出以上各種模型的ROC曲線以及模型評價引數；對潛在的生物標誌物組合提供7種可選模型，並同時可以進行4種模型ROC和評價；
第六，Qi MetA針對不同場景，不僅可處理代謝組學和脂質組學等組學資料，同時也可以處理臨床資料和其他生物學資料；每次分析按照專案分類，歷史記錄查詢以及斷點工作繼續非常方便；瀏覽、處理、瀏覽、處理 …… 透明化的流程使結果更加可信。
“Qi MetA軟體的釋出，是騏驥資料分析和利用工作的第一步，也是騏驥和Waters共同探索和挖掘資料價值的開始。未來，騏驥會在Qi MetA的資料分析平臺上，開發更多的場景化應用，形成醫療軟體，更深入探究資料價值，提供更有效的資料解決方案，包括資料前處理的功能拓展、生物學功能的深入闡述、生物知識圖譜的研究。”陳顯揚說道。
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投資人和專家紛紛看好
另外，在本次釋出會上，來自遠毅資本、中國中醫科學院中藥研究所、中國農業科學院、清華大學第一附屬醫院以及京東醫療雲的投資人和專家也分別提出了自己的觀點和疑問。
遠毅資本副總裁宋依然介紹道，遠毅資本是一家國際風險投資基金，專注於投資醫療健康和創新金融技術領域的早期和成長期企業。公司從去年年底開始接觸到騏驥生物公司，到今年初完成了投資。騏驥生物在代謝組學技術方面做的十分紮實，擁有創新性的臨床開發能力，在資料分析方面有著獨到的見解和經驗。希望這次合作，能夠真正幫助使用者解決臨床的問題，最終服務於人類的健康。
中國中醫科學院中藥研究所徐江博士認為該軟體非常“軟”，貼近使用者需求，讓資料分析不再是工作的瓶頸問題。在問到基因組學的研究是否可以使用Qi MetA軟體時，騏驥生物研發團隊表示，Qi MetA中的“Met”不僅僅指的是“Metabolism”即代謝，同時也是指“Methodology”。儘管Qi MetA是以代謝研究為開發核心場景，但是我們也重在方法學的提煉和場景的擴大。目前軟體裡面的大部分功能同樣適用於基因組學的研究。比如，統計學差異分析、資料的分類和聚類的視覺化，以及分類模型等等。
京東醫療雲部門馬睿澤指出，Qi MetA是否可以在藥廠使用？而答案是肯定的。騏驥生物團隊表示，Qi MetA在前端顯示是一套軟體，但其後端是一個功能專案平臺，有一個解決方案的程式碼倉庫。同時，我們通過個性化設計，可以對不同客戶在軟體前端推送不同的解決方案和分析專案。如果針對藥廠的客戶，我們軟體在保留統計學分析和視覺化的基礎上，可以個性化的推送“藥代動力學”自動分析功能等等。這樣我們的軟體平臺可以服務於醫學領域各個場景的需要。
最後，王文軍表示：“Qi MetA作為一款個性化的資料分析和挖掘軟體，得到了沃特世科技（上海）有限公司的鼎力支援，以及同行、專家、學者的幫助，大家的認可和鼓勵，也給我們繼續向前的信心。通過這個資料平臺，我們未來有信心提高代謝病分析水平，更有效地進行疾病的早期檢測與臨床診斷，最終成為精準醫療和智慧診斷的開拓者和先驅者。”