藉助基因組分析 科學家知曉了可可樹不同品種的馴化路徑
習慣了咖啡、巧克力的現代人，或許難以想象沒有了可可樹的生活會變成什麼樣。 而為了讓未來的巧克力變得更加可口，一支研究團隊將可可樹的起源，追溯到了幾千年前的單一馴化事件，揭示了隱藏在其基因組中的其它線索。 在 2010 年完成了對 Theobroma Cacao 植物的全基因組測序後，科學家們能夠以此為起點，展開更多的深入研究。
Theobroma 樹上的可可豆莢（圖自： ofollow,noindex">Luisovalles / 維基百科 ）
本文介紹的這支研究團隊， 對 200 種單株植物進行了測序，並將它們與原型基因組（Archetype Genome）進行了比較， 以描繪出更加完整的“可可樹編年史”。
研究團隊選擇了第一個被馴化的可可變種 Criollo，分析表明其可以追溯到大約 3600 年前、位於中美洲的一次馴化事件。（公元前 2480~10900 年間的範圍）
團隊表示，Criollo 來自亞馬遜河流域，但很可能在北美洲中部進行了貿易，並在那裡開始了馴化的過程。最初的規模可能是 738 棵。（估算範圍在 437~2674 棵之間）
選擇和培育該植物的重點，是改善其風味、抗病性、以及作為興奮劑的可可鹼的含量。遺憾的是，並非所有的陽性特徵都流傳至今。
降低作物產量的基因，也被匯入了現代的 Criollo 可可。這或許可以解釋為何現在不怎麼種植 Criollo，因為這種變體只佔全球可可產量的 5% 。
（研究配圖 - 2：群體基因組分析，馴化過程見解）
Forastero 是當前商業巧克力中最常見的變體，但 Criollo 被認為比它更美味。通過對遺傳特徵的深入瞭解，我們有望結合不同變種的最佳特徵，培育出更加理想的後代。
研究作者 Omar Cornejo 說到 —— 我們希望擁有一種方法，將來自高產量品種（比如 Iquitos）的特徵，與 Criollo 源種結合起來，從而培育出更優秀的成果。
有關這樣研究的詳情，已經發表在近日出版的《生物學通訊》（ Communications Biology ）期刊上。 原標題為：
《Population genomic analyses of the chocolate tree, Theobroma cacao L., provide insights into its domestication process》