目標檢測算法系列:faster RCNN實現|附python原始碼
目標檢測一直是計算機視覺中比較熱門的研究領域,有一些常用且成熟的演算法得到業內公認水平,比如RCNN系列演算法、SSD以及YOLO等。如果你是從事這一行業的話,你會使用哪種演算法進行目標檢測任務呢?在我尋求在最短的時間內構建最精確的模型時,我嘗試了其中的R-CNN系列演算法,如果讀者們對這方面的演算法還不太瞭解的話,建議閱讀 ofollow,noindex" target="_blank">《目標檢測演算法圖解:一文看懂RCNN系列演算法》 。在掌握基本原理後,下面進入實戰部分。
本文將使用一個非常酷且有用的資料集來實現faster R-CNN,這些資料集具有潛在的真實應用場景。
問題陳述
資料來源於醫療相關資料集,目的是解決血細胞檢測問題。任務是通過顯微影象讀數來檢測每張影象中的所有紅細胞(RBC)、白細胞(WBC)以及血小板。最終預測效果應如下所示:
選擇該資料集的原因是我們血液中RBC、WBC和血小板的密度提供了大量關於免疫系統和血紅蛋白的資訊,這些資訊可以幫助我們初步地識別一個人是否健康,如果在其血液中發現了任何差異,我們就可以迅速採取行動來進行下一步的診斷。
通過顯微鏡手動檢視樣品是一個繁瑣的過程,這也是深度學習模式能夠發揮重要作用的地方,一些演算法可以從顯微影象中分類和檢測血細胞,並且達到很高的精確度。
本文采用的血細胞檢測資料集可以從 這裡下載,本文稍微修改了一些資料:
- 邊界框已從給定的.xml格式轉換為.csv格式;
- 隨機劃分資料集,得到訓練集和測試集;
這裡使用流行的Keras框架構建本文模型。
系統設定
在真正進入模型構建階段之前,需要確保系統已安裝正確的庫和相應的框架。執行此專案需要以下庫:
- pandas
- matplotlib
- tensorflow
- keras – 2.0.3
- numpy
- opencv-python
- sklearn
- h5py
對於已經安裝了Anaconda和Jupyter的電腦而言,上述這些庫大多數已經安裝好了。建議從 此連結下載 requirements.txt檔案,並使用它來安裝剩餘的庫。在終端中鍵入以下命令來執行此操作:
pip install -r requirement.txt
系統設定好後,下一步是進行資料處理。
資料探索
首先探索所擁有的資料總是一個好開始(坦率地說,這是一個強制性的步驟)。對資料熟悉有助於挖掘隱藏的模式,還可以獲得對整體的洞察力。本文從整個資料集中建立了三個檔案,分別是:
train_images test_images train.csv
讀取 .csv
檔案並打印出前幾行:
# importing required libraries import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt %matplotlib inline from matplotlib import patches # read the csv file using read_csv function of pandas train = pd.read_csv(‘train.csv’) train.head()
訓練檔案中總共有6列,其中每列代表的內容如下:
image_names cell_type xmin xmax ymin ymax
下面打印出一張圖片來展示正在處理的影象:
# reading single image using imread function of matplotlib image = plt.imread('images/1.jpg') plt.imshow(image)
上圖就是血細胞影象的樣子,其中,藍色部分代表WBC,略帶紅色的部分代表RBC。下面看看整個訓練集中總共有多少張影象和不同型別的數量。
# Number of classes train['cell_type'].value_counts()
結果顯示訓練集有254張影象。
# Number of classes train['cell_type'].value_counts()
結果顯示有三種不同型別的細胞,即RBC,WBC和血小板。最後,看一下檢測到的物件的影象是怎樣的:
fig = plt.figure() #add axes to the image ax = fig.add_axes([0,0,1,1]) # read and plot the image image = plt.imread('images/1.jpg') plt.imshow(image) # iterating over the image for different objects for _,row in train[train.image_names == "1.jpg"].iterrows(): xmin = row.xmin xmax = row.xmax ymin = row.ymin ymax = row.ymax width = xmax - xmin height = ymax - ymin # assign different color to different classes of objects if row.cell_type == 'RBC': edgecolor = 'r' ax.annotate('RBC', xy=(xmax-40,ymin+20)) elif row.cell_type == 'WBC': edgecolor = 'b' ax.annotate('WBC', xy=(xmax-40,ymin+20)) elif row.cell_type == 'Platelets': edgecolor = 'g' ax.annotate('Platelets', xy=(xmax-40,ymin+20)) # add bounding boxes to the image rect = patches.Rectangle((xmin,ymin), width, height, edgecolor = edgecolor, facecolor = 'none') ax.add_patch(rect)
keras_frcnn
庫來訓練搭建的模型以及對測試影象進行預測。
faster R-CNN實現
為了實現 faster R-CNN演算法,本文遵循 此Github儲存庫 中提到的步驟。因此,首先請確保克隆好此儲存庫。開啟一個新的終端視窗並鍵入以下內容以執行此操作:
git clone https://github.com/kbardool/keras-frcnn.git
並將 train_images
和 test_images
資料夾以及 train.csv
檔案移動到該儲存庫目錄下。為了在新資料集上訓練模型,輸入的格式應為:
filepath,x1,y1,x2,y2,class_name
其中:
- filepath是訓練影象的路徑;
- x1是邊界框的xmin座標;
- y1是邊界框的ymin座標;
- x2是邊界框的xmax座標;
- y2是邊界框的ymax座標;
- class_name是該邊界框中類的名稱;
這裡需要將 .csv
格式轉換為 .txt
檔案,該檔案具有與上述相同的格式。建立一個新的資料幀,按照格式將所有值填入該資料幀,然後將其另存為 .txt
檔案。
data = pd.DataFrame() data['format'] = train['image_names'] # as the images are in train_images folder, add train_images before the image name for i in range(data.shape[0]): data['format'][i] = 'train_images/' + data['format'][i] # add xmin, ymin, xmax, ymax and class as per the format required for i in range(data.shape[0]): data['format'][i] = data['format'][i] + ',' + str(train['xmin'][i]) + ',' + str(train['ymin'][i]) + ',' + str(train['xmax'][i]) + ',' + str(train['ymax'][i]) + ',' + train['cell_type'][i] data.to_csv('annotate.txt', header=None, index=None, sep=' ')
下一步進行模型訓練,使用 train_frcnn.py
檔案來訓練模型。
cd keras-frcnn python train_frcnn.py -o simple -p annotate.txt
由於資料集較大,需要一段時間來訓練模型。如果條件滿足的話,可以使用GPU來加快訓練過程。同樣也可以嘗試減少 num_epochs
引數來加快訓練過程。
模型每訓練好一次(有改進時),該特定時刻的權重將儲存在與“model_frcnn.hdf5”相同的目錄中。當對測試集進行預測時,將使用到這些權重。
根據機器的配置,可能需要花費大量時間來訓練模型並獲得權重。建議使用本文訓練大約500個時期的權重作為初始化。可以從 這裡 下載這些權重,並設定好相應的路徑。
因此,當模型訓練好並儲存好權重後,下面進行預測。 Keras_frcnn
對新影象進行預測並將其儲存在新資料夾中,這裡只需在 test_frcnn.py
檔案中進行兩處更改即可儲存影象:
-
從該檔案的最後一行刪除註釋:
- cv2.imwrite('./ results_imgs / {}。png'.format(idx),img);
-
在此檔案的倒數第二行和第三行添加註釋:
- #cv2.imshow('img',img) ;
- #cv2.waitKey(0);
使用下面的程式碼進行影象預測:
python test_frcnn.py -p test_images
最後,檢測到物件的影象將儲存在“results_imgs”資料夾中。以下是本文實現faster R-CNN後預測幾個樣本獲得的結果:
結果1
結果2
結果3
結果4
總結
R-CNN演算法確實是用於物件檢測任務的變革者,改變了傳統的做法,並開創了深度學習演算法。近年來,計算機視覺應用的數量突然出現飆升,而R-CNN系列演算法仍然是其中大多數應用的核心。
Keras_frcnn
也被證明是一個很好的物件檢測工具庫,在本系列的下一篇文章中,將專注於更先進的技術,如YOLO,SSD等。
作者資訊
PULKIT SHARMA,機器學習和深度學習
本文由阿里雲雲棲社群組織翻譯。
文章原標題《A Practical Implementation of the Faster R-CNN Algorithm for Object Detection (Part 2 – with Python codes)》,譯者:海棠,審校:Uncle_LLD。
文章為簡譯,更為詳細的內容, 請檢視原文 。