這兩者都是命令替換，命令替換是指：是Shell 執行命令並將命令替換部分替換為執行該命令後的結果。

比如：

[bob@centos home]$ val=hello
[bob@centos home]$ echo $(echo $val)
hello
[bob@centos home]$ echo `echo $val`
hello

或者：

[[email protected] home]$ echo $(date)
2017年 06月 25日 星期日 20:24:20 CST
[[email protected] home]$ echo `date`
2017年 06月 25日 星期日 20:24
 
:28 CST

區別：
反引號是 Bourne shell遺留下來的。
而()是POSIX支持，同時也兼容反引號。()對命令的巢狀更清晰，更方便。
主要提倡使用$() 而不是 使用反引號有以下幾個原因：

（1）當你寫了這種命令使用反引號是會眼花的。而使用括號就清晰很多，巢狀也很方便。

libdir=$(dirname $(dirname $(which gcc)))/lib

libdir=`dirname \`dirname \\\`which gcc\\\`\``/lib

（2）還有一個原因對反斜槓的處理
只有兩個反斜槓時

[[email protected]
 
 home]$ echo "`echo \\a`"; echo "$(echo \\a)"
a  
\a

增加後

[[email protected] home]$ echo "`echo \\\a`"; echo "$(echo \\\a)"
\a
\a

在加一個

[[email protected] home]$ echo "`echo \\\\a`"; echo "$(echo \\\\a)"
\a
\\a

面對單引號中如此詭異的行為，我有點發虛。
在看看在括號中，將反斜槓當做轉義，都可以解釋清楚。

（3）反引號 巢狀使用需要反斜槓轉義

[bob@centos
 
 home]$ echo $(echo $(date))
2017年 06月 25日 星期日 20:42:32 CST
[bob@centos home]$ echo `echo `date``
date
[bob@centos home]$ echo `echo \`date\``
2017年 06月 25日 星期日 20:42:42 CST
[bob@centos home]$ 

綜上所述：$() 是被提倡使用的也是首選方法，它具有清晰的語法，提高人的可讀性，巢狀很直觀，內部解析分開的對反引號的解析也符合人們的常識。而反引號是不被推薦的，其容易偽裝的語法，而外觀極其像單引號，而不推薦被使用。

參考：