APKTOOL是目前反編譯ANDROID apk的主要工具，可以反編譯出APK裡的資原始檔和smali程式碼，而有些APK開發者為了防止自己的程式碼被反編譯，針對APKTOOL工具加固程式碼，使得APKTOOL無法執行正常，比如這篇文章介紹的Android應用資原始檔格式解析與保護對抗研究，因此有必要根據具體情況修改APKTOOL原始碼重新編譯，本人花了一天時間來編譯除錯，現將具體的過程分享一下。

一. 下載原始碼
APKTOOL原始碼下載，github上直接DOWNLOAD或者使用GIT來下載，最好使用GIT，它依賴什麼專案就會自動的去下載。

二. 原始碼編譯

編譯可以直接使用APKTOOL目錄下的gradlew.bat命令，我使用了ANDROID STUDIO來編譯原始碼。

1. 原始碼匯入ANDROID STUDIO
“FILE”->”OPEN…”->原始碼目錄

2. 編譯
最右邊”Gradle”->重新整理同步
這時會自動的從網路上下載指定版本的gradle，如果gradle設定的是offline的話，gradle同步不了，需將gradle設定的offline的選擇去掉。
“FILE”->”Settings”->”Build,Execution,Deployment”->”Gradle”

同步成功的話，gradle視窗會出現如下的任務列表。

在任務列表裡選擇如下的任務雙擊執行，APLTOOL的主要類在brut.apktool:apktool-cli模組裡，執行”fatjar”任務生成專案的jar檔案。

這時會在專案目錄下自動建立了brut.apkool.smali資料夾(資料夾不存在的話)，然而編譯會報錯，找不到brut.apkool.smali下的原始碼。

因為brui.apktool:apktool-cli依賴brui.apktool:apktool-lib，brui.apktool:apktool-lib依賴brut.apkool.smali下的模組，brui.apktool:apktool-lib的build.gradle內容如下：

dependencies {
    compile("junit:junit:4.10") {
        exclude(module: 'hamcrest-core'
 
)
    }

    compile project(':brut.j.dir'),
            project(':brut.j.util'),
            project(':brut.j.common'),
            project(':brut.apktool.smali:util'),
            project(':brut.apktool.smali:dexlib2'),
            project(':brut.apktool.smali:baksmali'),
            project(':brut.apktool.smali:smali'),
            depends.snakeyaml,
            depends.xmlpull,
            depends.guava,
            depends.commons_lang

    testCompile depends.xmlunit
}

brut.apkool.smali下原始碼是空的，這是另一個專案的原始碼，需要先下載下來。

有兩種方式下載：
1. 直接訪問https://github.com/JesusFreke/smali下載原始碼，原始碼下載完成後將目錄下的所有檔案複製到brut.apkool.smali資料夾下。
2. 使用gradlew.bat applyPatches命令，這個會將本專案依賴的其他專案原始碼都同步下來，並下載到指定的目錄裡，不過這需要先按照git。

smali原始碼新增完成後再次執行任務，還是會報錯”util”模組找不到。

檢視brut.apktool.smali:baksmali的build.gradle內容

dependencies {
    compile project(':util')
    compile project(':dexlib2')
    compile depends.commons_cli
    compile depends.guava

    testCompile depends.junit
    testCompile project(':smali')
}

其依賴util模組，而在目錄下明明就有util模組，為什麼找不到它呢？
通過上網查找了一下資料，瞭解了每個專案只能有一個settings.gradle，包含本專案下的所有的模組，apktool的settings.gradle內容如下：

include 'brut.j.common',
        'brut.j.util',
        'brut.j.dir',
        'brut.apktool.smali:util',
        'brut.apktool.smali:dexlib2',
        'brut.apktool.smali:baksmali',
        'brut.apktool.smali:smali',
        'brut.apktool.smali:dexlib2:accessorTestGenerator',
        'brut.apktool:apktool-lib',
        'brut.apktool:apktool-cli'

其中並沒有util模組，這裡之所以是util，是因為brut.apkool.smali是我後加入的另一個專案，在它的專案settings.gradle檔案裡是包含了，內容如下：

include 'util', 'dexlib2', 'baksmali', 'smali', 'dexlib2:accessorTestGenerator'

所以直接編譯brut.apkool.smali是可以的，如果放在APKTOOL專案裡編譯就有問題了，解決方法就是將’:util’改為’:brut.apktool.smali:util’，同理其他的也一起改掉。

修改完了再次執行任務，還是報錯。

在brut.apktool\apktool-lib\src\main\java\brut\androlib\src\SmaliDecoder.java檔案裡出現了兩個錯誤，ClassPath沒有dontLoadClassPath靜態變數，baksmaliOptions沒有DIFFPRE靜態變數，我也沒弄明白我下載的都是最新的smali程式碼，為什麼smali類裡會沒有相關變數。

ClassPath.dontLoadClassPath = mDebug;
options.registerInfo = (mDebug ? baksmaliOptions.DIFFPRE : 0);

我把ClassPath.dontLoadClassPath = mDebug;直接去掉，baksmaliOptions.DIFFPRE改為baksmaliOptions.ALL。

修改完後終於編譯通過了，在Apktool\brut.apktool\apktool-cli\build\libs目錄下成功生成apktool-cli.jar。

三. 除錯
“Edit Configurations”->”+”->jar application設定如下內容->”ok”

在apktool-cli下的[email protected]設定斷點，Shift+F9除錯成功。