菜鳥 ubuntu下安裝scipy全過程 （主要是安裝atlas）
參考資料：
atlas官方主頁：http://math-atlas.sourceforge.net/
http://210.75.240.148/blog-449511-577597.html
http://blog.csdn.net/zxia1/article/details/8164746
http://blog.sina.com.cn/s/blog_6cb8e53d0101keak.html
LAPACK版本：LAPACK 3.5.0
SCIPY版本 ：3.11.17
python版本：2.7
首先明確幾個庫的關係：
ATLAS是python下的一個線性代數庫，是基於線性代數庫lapack的；
NumPy提供了一個在python中做科學計算的基礎庫，它重在數值計算，甚至可以說是用於多維陣列處理的庫；
SciPy是基於numpy，提供了一個在python中做科學計算的工具集，也就是說它是更上一個層次的庫；
許多人說NumPy依賴於ATLAS，但是實測我自己沒有安裝ATLAS成功安裝NumPy，不過直接安裝scipy卻報缺少BLAS庫，因此選擇了BLAS的優化ATLAS進行安裝。
預處理：
根據atlas的安裝文件,安裝前，要先要禁掉CPU Throtting。由於我使用的是虛擬機器，只有一個核，故而不需要此步，但仍然列出： 在Ubuntu系統上要首先安裝cpufrequtils和cpufreqd這兩個包, 也許還要安裝powernowd包, 然後執行sudo /usr/bin/cpufreq-selector –g
1. 安裝LAPACK
網上的教程很多直接用LAPACK的壓縮包作為ATLAS的引數，我 真正安裝scipy的時候也是用的壓縮包，不過這裡仍然給出完整安裝lapack的教程。（網上現有教程版本較老，實際操作需要有所改動，安裝的時候我快糾結得要死）
(1)解壓LAPACK，將lapack源目錄下的make.inc.example 改名make.inc：
mv make.inc.example make.inc
(2)編輯一下make.inc，將編譯器指定為你的編譯器ifort或者gfortran (我沒做修改)
(3)修改一下那個makefile,其實裡面有個讓你選的，
#lib : blaslib ,lapacklib , tmglib ...
lib : lapacklib ,tmglib ,..
改成
lib :blaslib ,lapacklib,tmglib ..
# lib :lapacklib ,tmglib ,..
(4) make
最後生成3個.a檔案：
2. 安裝ATLAS
ATLAS 完整安裝步驟主要分5步，僅configure和build是必需的。下面是官網介紹：
- configure: Tell the ATLAS build harness where your SRCdir and BLDdir directories are, and allow ATLAS to probe the platform to create ATLAS's Make.inc and BLDdir directory tree.
- build: Tune ATLAS for your platform, and build the libraries.
- check: Run sanity tests to ensure your libraries are producing correct answers.
- time: Run basic timing on various ATLAS kernels in order to make sure the tuning done in the build step has resulted in efficient implementations.
- install: Copy ATLAS's libraries from the BLDdir to some standard location.
SRCdir：the path to your ATLAS source directory (eg, /home/whaley/ATLAS3.8.0).
BLDdir： the path to your ATLAS build directory (eg, /home/whaley/ATLAS3.8.0/Linux_P4E64SSE3).
2個檔案目錄不允許相同，但BLDdir可以不在SRCdir子目錄下。
（2）從官網下載ATLAS庫，解壓到ATLASSRCdir資料夾，然後進入該資料夾，執行：
mkdir Linux_C2D64SSE3
cd Linux_C2D64SSE3 # enter BLDdir
../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=2800 -Fa alg -fPIC --with-netlib-lapack-tarfile=/home/haiyu/Programs_Install/lapack-3.5.0.tgz --prefix=/usr/local/atlas
粗體引數需要根據個人系統修改：
-b 指定編譯出庫的型別（32位庫還是64位庫）
-D c -DPentiumCPS 是指定你的CPU的時鐘頻率，可以通過 grep MHz /proc/cpuinfo 得到
-Fa alg -fPIC 得到與位置無關的程式碼，生成動態的共享庫
--prefix 為安裝路徑
--with-netlib-lapack-tarfile 則是lapack壓縮包路徑
成功configure的結果應該如下：
（3）編譯：make build
這個過程相當漫長，耐心等待！！
（4）可選步驟：check編譯結果
make check
make ptcheck (對於多核伺服器)
make time
如果check過程中沒有報錯，則可以放心進行以後的步驟；如果出現報錯，也可以嘗試進行後續步驟，是否成功就要靠人品了。反正我當時每步貌似都報錯了o(╯□╰)o 不過目前看來沒有影響。
3.安裝scipy等python庫
對於python 2.7 可以直接執行：
sudo apt-get install python-numpy
sudo apt-get install python-scipy
sudo apt-get install python-matplotlib
4.驗證scipy是否正確安裝
開啟Terminal，輸入：
python
>>>import scipy.io as io
沒有報錯則安裝成功！