在B2B領域，為確保您通過網際網路與業務合作伙伴（如供應商，客戶，物流提供商，金融機構）交換文件的安全性，推薦的方式與許多通訊協議使用的加密方法相同，例如AS2和SFTP。這些通訊協議使用公鑰和私鑰證書 – 一組用於傳送方，一組用於接收接收 – 同時利用數字證書實現金鑰對的輕鬆交換和管理。（請參閱數字證書如何幫助確保EDI資料的安全性。）使用此方式，您需要作出一個決定：如何生成公司使用的數字證書。

生成數字證書有兩種選擇：

（1）您可以使用特殊軟體生成自己的數字證書 – 自簽名證書

（2）您可以使用Verisign和Entrust等證書頒發機構（CA）生成的數字證書。如果數字證書由CA生成，則通常有效期為一年或兩年。

或者如果您自己生成，則可以使其在更長的時間內有效。當證書過期時，需要續訂或更換證書，並且您必須在到期之前向您的貿易伙伴提供新證書，以確保您交換的關鍵業務單據（例如採購訂單和發票）可以繼續不間斷地傳輸。

如果使用證書頒發機構頒發的數字證書，除提供證書外，還可以提供以下服務，比如：

• 如果證書被洩露 – 例如，私鑰已丟失或被盜 – CA可以在它到期之前“撤銷”它。這些已撤銷的證書將放在撤銷列表中，該列表會在您使用之前由您的軟體自動檢查以驗證證書。
• CA通過驗證其憑據來確保證書持有者是他們聲稱的身份。 這為您與之交換文件的任何業務合作伙伴提供了額外的可靠性保證。
• 在合作伙伴證書的到期日期內，CA將定期驗證您的貿易伙伴的身份，進一步提高系統的安全性。

使用自簽名證書，允許他們設定自己的到期日期。 這種方法的好處包括：

• 它是免費的，因為許多B2B軟體應用程式都包含證書自生成功能(RSSBus EDI內建生成數字證書功能)。
• 您可能會減少管理難度，因為可以設定更長的證書到期日期，比如說5年或10年。但是，具有較長的到期日期會降低系統的整體安全性，因為沒有組織“監管”系統並確認證書被正確使用。

如果您的貿易合作伙伴設定了規則，您可能需要支援這兩種模式，一些合作伙伴要求您使用來自CA的證書，而其他合作伙伴則接受自簽名證書。 無論您選擇哪種方式，都必須注意不要失去對私鑰的訪問許可權（例如，忘記自己的密碼），因為CA和自行生成證書的系統