本文主要介紹atlas的安裝。

一、使用到的安裝包主要有blas，cblas，lapack，atlas。

   blas和cblas的安裝包下載地址為 ：

         http://www.netlib.org/blas/blas.tgz

  lapack的官方包地址： http://www.netlib.org/lapack/

  atlas的官方包地址：http://sourceforge.net/projects/math-atlas/

  PS：安裝過程中會使用到gfortran編譯器，如果沒有安裝則使用sudo apt-get install gfortran進行安裝。

二、 blas的安裝

下載檔案後，對壓縮包進行解壓，進入目錄，執行命令為：

gfortran -c  -O3 *.f  # 編譯所有的 .f 檔案，生成 .o檔案  
ar rv libblas.a *.o  # 連結所有的 .o檔案，生成 .a 檔案  
su cp libblas.a /usr/local/lib  # 將庫檔案複製到系統庫目錄

三、cblas的安裝

進入CBLAS資料夾，根據你自己的計算機平臺，將目錄下某個 Makefile.XXX 複製為 Makefile.in , XXX表示計算機的平臺，如果是Linux，那麼就將Makefile.LINUX 複製為 Makefile.in，然後使用下面的命令安裝：

cp ../BLAS/libblas.a  testing  # 將上一步編譯成功的 libblas.a 複製到 CBLAS目錄下的testing子目錄  
make # 編譯所有的目錄  
sudo cp lib/cblas_LINUX.a /usr/local/lib/libcblas.a # 將庫檔案複製到系統庫目錄下  
 

四、lapack的安裝

編譯 lapack以及lapacke，這一步比較麻煩，首先當然是進入lapack-3.4.2資料夾，然後根據平臺的特點，將INSTALL目錄下對應的make.inc.XXX 複製一份到 lapack-3.4.2目錄下，並命名為make.inc, 這裡我複製的是 INSTALL/make.inc.gfortran，因為我這裡用的是gfortran編譯器。

修改lapack-3.4.2/Makefile, 因為lapack以來於blas庫，所以需要做如下修改

#lib: lapacklib tmglib

lib: blaslib variants lapacklig tmglib

make # 編譯所有的lapack檔案  
cd lapacke # 進入lapacke 資料夾，這個資料夾包含lapack的C語言介面檔案  
make # 編譯lapacke  
cp include/*.h /usr/local/include #將lapacke的標頭檔案複製到系統標頭檔案目錄  
cd .. #返回到 lapack-3.4.2 目錄  
cp *.a /usr/local/lib # 將生成的所有庫檔案複製到系統庫目錄  

五、altas的安裝

這個比較麻煩，不過可以直接使用命令sudo apt-get install libatlas-dev來進行安裝。如果想自己手動編譯原始碼，那是要費寫波折的，主要問題是由於在編譯atlas原始碼的過程中需要關閉intel晶片即CPU的 throttling。但是目前網站上提供的一些關閉方法都已經行不通了，這主要是CPU晶片的驅動問題，官方的驅動會使得網上的那些方法失效，並不能真的關閉cpu throttling。

經過我資料的查閱，終於找到了解決辦法，現在先列舉一些網上常見的方法，可以先進行測試，如果可以真正關閉cpu throttling那就最好了。現在列舉方法：

1.安裝cpufreqd和cpufrequtils，然後用命令關閉：

sudo apt-get install gnome-applets
sudo apt-get install gnome-applets-data
sudo /usr/bin/cpufreq-selector -g performance

通過測試，發現如果是多CPU時，該命令並不能完全更改所有cpu的效能模式，當然更沒有關閉cpu throttling，不過Ubuntu12.04及以前的版本可能會關閉cpu throttling。 我在Ubuntu14.04 以後得版本測試都不行。

2 使用cpupower來修改cpu模型：

# 輸入命令cpupower, 會提示你如何安裝cpupower

sudo apt-get install linux-版本號-generic #根據提示的名字寫
sudo cpupower frequency-set -g performance

這個命令可以全部修改cpu模式。想要檢視cpu的模式可以使用下面的命令：

cat /sys/devices/system/cpu/cpu{0,1,2,3}/cpufreq/scaling_governor

會得到類似下面的結果：

performance
performance
performance
performance

單從結果上看貌似已經修改了cpu的模式，其實不然，當編譯atlas時，還是會報錯，說沒有關閉cpu throttling。如下面的錯誤：

CPU Throttling apparently enabled!
It appears you have cpu throttling enabled, which makes timings
unreliable and an ATLAS install nonsensical.  Aborting.
See ATLAS/INSTALL.txt for further information

現在來說說如何徹底關閉cpu throttling（當然是軟體臨時性關閉，因此也可以從BOIS裡面進行關閉）。必須載入cpu驅動的其他模組，其實只要關閉一個就行了，程式碼如下：

sudo vim /etc/default/grub
#修改其中的一行程式碼
GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="intel_pstate=disable"

然後用命令更新一下：

sudo grub_mkconfig -0 /boot/grub/grub.cfg

如果還是報錯，那重啟一次就應該沒問題了。

接下來再用上述的第二種方法關閉cpu throttling就好了。

既然關閉好cpu throttling了，接下來就可以編譯atlas了。這個網上教程還是有的，這裡給出一個常規的步驟：

bunzip2 -c atlas3.10.x.tar.bz2 | tar xfm -    # create SRCdir
mv ATLAS ATLAS3.10.x                          # get unique dir name
mkdir build                         # create BLDdir
cd build                            # enter BLDdir
../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=2400 \   # configure command
    --prefix=/home/whaley/lib/atlas \           # install dir
    --with-netlib-lapack-tarfile=/home/whaley/dload/lapack-3.4.1.tgz  #lapack所在的目錄
make build                                    # tune & build lib
make check                                    # sanity check correct answer
make ptcheck                                  # sanity check parallel
make time                                     # check if lib is fast
make install                                  # copy libs to install dir

其中需要注意的就是配置引數，如果想生成動態連結庫，使用下面的命令配置：

../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=2400 -Fa alg -fPIC \   # configure command
    --prefix=/home/whaley/lib/atlas \           # install dir
    --with-netlib-lapack-tarfile=/home/whaley/dload/lapack-3.4.1.tgz  #lapack所在的目錄

至此基本就結束了，如果遇到問題可以繼續討論。