The first step of machine larning .

環境配置：

OS：ubuntu 10.04

Python ：Python 2.6.5

1.安裝nose

這個安裝還比較順利，基本沒報錯。。。

下載nose： https://nose.readthedocs.org/en/latest/

cd nose-1.3.4
python setup.py install
檢驗安裝成功：
#python
>>> import nose
>>> nose
<module 'nose' from '/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/nose-1.3.4-py2.6.egg/nose/__init__.pyc'>
>>> 
 

2.安裝 lapack

官方下載地址： http://www.netlib.org/lapack/

我下的是lapack-3.5.0.tgz。下好了，暫時放著，後面有用。。。

3.安裝atlas

下載地址： http://sourceforge.net/projects/math-atlas/，下載最新版本：atlas3.10.2.tar.bz2 （下載日期：2014-10-26）

tar -jxvf atlas3.10.2.tar.bz2  cd ATLAS mkdir myobj64 cd myobj64

配置configure：

第一種配置方式（筆者使用第一種方式的，第二種沒試過）： ../configure -b 32 -Fa alg -fPIC -shared –prefix=/配置atlas的安裝路徑/ATLAS -–with-netlib-lapack-tarfile=/lapack安裝壓縮檔案存放的目錄/lapack-3.5.0.tgz

-–with-netlib-lapack-tarfile 這個編譯選項 前面是 ‘--’ 2個 橫杆。網上很多都是一個的，一頓報錯了。。看了裡面的configure原始檔才知道。。。

第二種配置方式：

sudo ../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=3901.000 -Fa alg -fPIC  –prefix=/opt/atlas3.10.2/ -–with-netlib-lapack-tarfile=/opt/lapack-3.5.0/lapack-3.5.0.tgz 其中的引數說明如下：        -b 指定編譯出庫的型別（32位庫還是64位庫）根據自己的機器來設定        -D c -DPentiumCPS 是指定你的CPU的時鐘頻率，可以通過 grep MHz /proc/cpuinfo 得到 numpy_scipy/ATLAS/my64Obj$ grep MHz /proc/cpuinfo    cpu MHz        : 3901.000    cpu MHz        : 3901.000    cpu MHz        : 3901.000    cpu MHz        : 3901.000         -Fa alg -fPIC 得到與位置無關的程式碼，生成動態的共享庫        –prefix 為安裝路徑        -–with-netlib-lapack 則是制定lapack庫檔案（此時lapack庫檔案還沒有生成，先隨便指定一個）

執行上述命令出錯，提示 Unable to find usable compiler for F77; abortingMake sure compilers are in your path, and specify good compilers to configure (see INSTALL.txt or ‘configure –help’ for details)make[1]: *** [atlas_run] Error 8 make[1]: Leaving directory `/home/homer/Downloads/tool_server/python/numpy_scipy/ATLAS/my64Obj’ make: *** [IRun_comp] Error 2 ERROR 512 IN SYSCMND: ‘make IRun_comp args=”-v 0 -o atlconf.txt -O 1 -A 26 -Si nof77 0 -V 480  -Fa ic ‘-fPIC’ -Fa sm ‘-fPIC’ -Fa dm ‘-fPIC’ -Fa sk ‘-fPIC’ -Fa dk ‘-fPIC’ -Fa xc ‘-fPIC’ -Fa gc ‘-fPIC’ -Fa if ‘-fPIC’ -b 64″‘ mkdir src bin tune interfaces cd src ; mkdir testing auxil blas lapack pthreads threads cd src/blas ; \            mkdir f77reference reference gemv ger gemm kbmm \                  level1 level2 level3 pklevel3 這是因為Ubuntu系統沒有F77編譯器，需要安裝，安裝命令如下： sudo apt-get install fort77

ps:這個配置過程時間很長，我在虛擬機器上跑了好幾個小時。。。渣機器傷不起。。。最後還報了錯，不過直接忽略了，最後全部裝好，還是能用的。。

然後是：

make

make check

make time

make install

4.安裝 numpy

首先配置numpy目錄下的site.cfg檔案，指明atlas庫的位置：

下載地址： https://pypi.python.org/pypi/numpy

下載最新版本： numpy-1.9.0.tar.gz

tar -zxvf numpy-1.9.0.tar.gz cd numpy-1.9.0 接下來是配置 site.cfg檔案。這是網上有些文章是這麼介紹的，我也照做了，後來發現 不去配置也沒關係。因此我建議先不去配置，直接安裝：

python setup.py install

如果安裝沒有報錯了。。那就不要配置site.cfg了

ps:配置site.cfg檔案的方式可以看底下的參考文獻。

5.安裝scipy（大坑來了。。。）

下載地址： https://pypi.python.org/pypi/scipy，下載最新版本：scipy-0.14.0.tar.gz

tar -zxvf scipy-0.14.0.tar.gz

cd scipy-0.14.0

然後網上有些文章又說要配置site.cfg。可我在 解壓出來的資料夾裡更笨找不到這個site.cfg檔案。所以直接跳過這一步了。

然後執行

python setup.py install

又是一頓報錯。。。。

找到了 stackoverflow上同樣的問題以及答案。

原來在 安裝 scipy之前 還要安裝 blas

隨便找一個目錄，下載blas

wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
tar xzf blas.tgz
cd BLAS

## NOTE: The selected fortran compiler must be consistent for BLAS, LAPACK, NumPy, and SciPy.## For GNU compiler on 32-bit systems:#g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f                     # with g77#gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f    # with gfortran## OR for GNU compiler on 64-bit systems:#g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f                     # with g77
gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f    # with gfortran## OR for Intel compiler:#ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f# Continue below irrespective of compiler:
ar r libfblas.a *.o
ranlib libfblas.a
rm -rf *.o
export BLAS=~/自己的目錄/BLAS/libfblas.a

筆者的機器是32位，g77和gfortran編譯器都沒裝。剛開始打算安裝g77，發現這個編譯器幾乎要淘汰了，安裝包都找不到。

於是安裝了gfortran

按照下述操作即可

sudo apt-get update

sudo apt-get install gfortran

然後選擇上面的 編譯指令

gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f

ar r libfblas.a *.o ranlib libfblas.a rm -rf *.o

檢視下BLAS目錄，確認生成了libfblas.a.

export BLAS=/自己的目錄/BLAS/libfblas.a #這邊很重要，不然後面安裝scipy要報錯的。。。

然後再把第2步下載的lapack-3.5.0.tgz 解壓出來

tar xzf lapack.tgz
cd lapack-*/
cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc          # on Linux with lapack-3.2.1 or newer
make lapacklib
make clean
export LAPACK=~/自己的目錄/lapack-*/liblapack.a

最後一步的 export 改成自己的目錄。

最後，終於可以安裝 scipy了

回到剛才的scipy目錄

cd scipy-0.14.0

安裝
python setup.py install

6.驗證成功

開啟 python，注意在開啟python之前 不能在scipy這些目錄下，否則 在 import scipy的時候會報錯。

如下錯誤

[email protected]:~/machine_learning/scipy-0.14.0# python Python 2.6.5 (r265:79063, Oct  1 2012, 22:07:21)  [GCC 4.4.3] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> import scipy Traceback (most recent call last):   File "<stdin>", line 1, in <module>   File "scipy/__init__.py", line 112, in <module>     raise ImportError(msg) ImportError: Error importing scipy: you cannot import scipy while         being in scipy source directory; please exit the scipy source         tree first, and relaunch your python intepreter. >>> 

換個目錄，再進入python就好了。

[email protected]:~/machine_learning# python Python 2.6.5 (r265:79063, Oct  1 2012, 22:07:21)  [GCC 4.4.3] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> import nose >>> nose <module 'nose' from '/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/nose-1.3.4-py2.6.egg/nose/__init__.pyc'> >>> import numpy >>> numpy <module 'numpy' from '/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/numpy/__init__.pyc'> >>> import scipy >>> scipy <module 'scipy' from '/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/scipy/__init__.pyc'> >>> 

這樣子就表示安裝都成功了。。。

參考資料：