（資料科學學習手札66）在ubuntu伺服器上部署shiny
一、簡介
shiny是R中專門用於開發輕量級web應用的框架，在本地寫一個shiny應用並呼叫非常方便，但如果你希望你的shiny應用能夠以遠端的方式提供給更多人來使用，就需要將寫好的shiny應用部署到伺服器上，主要有兩種方式，第一種是將shiny應用釋出在shinyapps上，第二種是將你的shiny應用部署到自己租用的伺服器上，前者比較方便但遇到一些R包環境或中文顯示等問題時幾乎是無解的，而後者雖然麻煩，但更為自由，且從0開始自己動手的過程又何嘗不是一種極大的樂趣呢，本文就將針對在ubuntu 16.04伺服器上部署shiny server的流程進行詳細的說明；
二、環境配置
2.1 伺服器配置說明
我使用的伺服器是阿里雲ECS，ubuntu 16.04，2核8G記憶體，40G系統盤，如果條件允許的話，建議記憶體不要選擇過小，否則在編譯安裝一些R包如raster時會記憶體不足（當然你也可以通過swap的方式來增加虛擬記憶體，但速度是非常慢的），用於連線伺服器的工具為putty，通過putty登入伺服器：
2.2 安裝最新版R
首先我們需要安裝最新版的R（寫作此文時最新的穩定版本為3.6.1），檢視R官網對於ubuntu安裝最新版R的介紹：
按照上述步驟，首先用vim開啟對應的sources.list檔案：
sudo vim /etc/apt/sources.list
按i進入編輯模式，結合我們系統版本，把前面R官網說明頁面中的deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35新增進檔案中，按esc後，再按shift+:，輸入wq完成寫入並退出過程：
接著執行下列命令來安裝最新版的R，遇到y/n全部選擇y：
sudo apt-get update sudo apt-get install r-base
這時檢視R版本：
這時可以看到我們已經成功安裝了最新版本的R。
2.3 安裝Rstudio與Rstudio Server
接下來我們來安裝Rstudio以及Rstudio Server，用於遠端編寫及管理伺服器上的R程式，在官網對應的下載頁面找到對應我們系統版本的geb格式安裝包下載連結：
Rstudio：
Rstudio Server：
其實可以在伺服器中輸入wget 下載連結 來下載對應的檔案，但是無奈這樣下速度太慢，於是我在本地電腦用了梯子之後以很快的速度下載了Rstudio的geb檔案，然後用pscp上傳到我們的伺服器上的指定目錄下：
除此之外還需要安裝用以開啟geb格式檔案的相關程式：
sudo apt-get install gdebi
接下來執行下列命令安裝Rstudio：
sudo gdebi rstudio-1.2.1335-amd64.deb
同樣的方式，我們用pscp上傳Rstudio Server的安裝包到剛才的目錄下執行下列語句：
sudo gdebi rstudio-server-1.2.1335-amd64.deb
在完成上述命令後，我們可以通過訪問http://你的伺服器公網IP:8787來使用Rstudio Server服務：
這裡輸入的賬戶和密碼與伺服器登入賬戶與密碼一致，這裡不得不吐槽一下Rstudio Server的傻逼設定，這裡登入的賬戶和密碼不能已獲取超級使用者許可權，沒關係，我們新建一個沒有超級使用者許可權的使用者：
sudo adduser 使用者名稱
這樣我們就可以用這個無超級使用者許可權的賬號登入Rstudio Server：
可以看到熟悉的介面，就是個線上版的Rstudio，可以通過它來方便地修改伺服器上的R程式碼。
2.4 安裝shiny和shiny server
接下來到了最重要的地方，我們來安裝shiny和shiny server，首先我們在伺服器上的R環境中安裝shiny包：
安裝成功：
接下來安裝shiny server，同樣的在本地從官網下載對應的geb安裝包，然後用pscp上傳到指定目錄下：
執行下列命令來安裝shiny server：
sudo gdebi shiny-server-1.5.9.923-amd64.deb
安裝完成後訪問 http://伺服器公網IP:3838，這是shiny server的預設導引頁，若能顯示正常則證明shiny server安裝成功：
這時可以發現右側下方的應用沒有正常顯示，但這裡並沒有明確顯示具體的報錯資訊，為了在shiny應用出錯時能顯示具體的錯誤資訊，我們需要修改shiny server的配置檔案，執行下列命令開啟shiny server的配置檔案：
vim /etc/shiny-server/shiny-server.conf
如圖所示位置新增上兩行語句用於設定shiny應用出錯時顯示具體錯誤資訊，儲存退出，重新訪問剛才的頁面：
可以看出這時顯示的報錯資訊提示我們缺失rmarkdown包，在R環境中安裝rmarkdown後再次訪問此頁面：
這時可以看到對應的應用都已正常顯示，而這兩個應用所在的路徑在shiny server的配置檔案中有說明：
開啟對應路徑可以看到hello和rmd兩個資料夾，每個資料夾代表一個應用，其內部擁有標準的shiny應用的ui.R和server.R，有時也會有global.R來輔助程式執行：
同樣的，我們可以修改配置檔案中的預設應用路徑到我們自己的應用位置，而在管理shiny server執行上，主要用到下列命令：
#檢視狀態 sudo systemctl status shiny-server #開啟 sudo systemctl start shiny-server #停止 sudo systemctl stop shiny-server #重啟 sudo systemctl restart shiny-server
而直接訪問應用就是在剛才的引導頁url後面新增路徑資訊，如我們直接來訪問hello應用，http://伺服器公網IP:3838/sample-apps/hello/ ：
至此，我們就完成了在ubuntu上配置部署shiny應用的全部工作，當你想要部署新的應用時，只需要將應用對應資料夾放入應用預設目錄下再按照格式訪問即可。
以上就是本文的全部內容，如有筆誤或不清楚之處望指