DeepMind推出AlphaFold,挑戰“蛋白質摺疊問題”
12月初,DeepMind研發的AlphaFold在“蛋白質結構預測比賽”CASP中奪冠,戰勝了其他97個演算法。它預測出了43種蛋白質中25種蛋白質的最精確結構,而同類別排名第二的隊伍,只預測出了3種。
在這項挑戰賽中,各參賽隊伍的任務是“蛋白質摺疊問題”——基於蛋白質基因序列,預測其氨基酸殘基將摺疊成何種複雜的蛋白質3D結構。蛋白質越大,氨基酸之間的相互作用就越多,建模也就越複雜,困難會成倍上升。
資訊源:
https://deepmind.com/blog/alphafold/
點評
DeepMind稱,AlphaFold為“DeepMind在科學發現領域的第一個重要里程碑”,“一個燈塔專案”。其特點是從零開始模擬目標形狀,而並非以前被解決的蛋白質3D結構作為模板。
其影響首先表現在一些具體應用領域:
這一技術首先能幫助科學家更好理解蛋白質在人體內的作用。對於診斷和治療由蛋白質錯誤摺疊引起的阿爾茨海默症、帕金森症等疾病有重要作用。
同時,它還將使藥物研發變得更容易,降低試錯成本,節省資金和時間。
第三,它將有助於更好地設計蛋白質,例如推動可生物降解酶的研究,幫助人們解決石油、塑料等汙染問題。